Үндсэн ялгаа – Эксом ба РНХ-ийн дараалал
Нуклейн хүчлийн дараалал нь тухайн организмын ДНХ эсвэл РНХ-ийн тодорхой хэсэг дэх нуклеотидын дарааллыг тодорхойлох арга юм. Дараалал нь эсийн ДНХ, РНХ-ийн бүтцийг тодорхойлох, функциональ уургийг кодлодог зарим генийг ялгахад чухал ач холбогдолтой; Тиймээс эдгээр генийн мутаци болон генийн илэрхийлэлийг ойлгохын тулд дарааллыг ашиглаж болно. Sanger Sequencing арга буюу илүү дэвшилтэт Дараагийн үеийн дарааллын аргууд нь түгээмэл хэрэглэгддэг дарааллын аргууд юм. Экзомын дараалал гэдэг нь организмд агуулагдах экзонуудын иж бүрэн багц буюу кодлогч ДНХ-ийн бүсүүдийн дараалал, харин РНХ-ийн дараалал нь Рибонуклеины хүчлүүдийн (РНХ) дараалал тогтоох процедур юм. Энэ бол экзом болон РНХ-ийн дарааллын хоорондох гол ялгаа юм.
Экзомын дараалал гэж юу вэ?
Экзом нь тодорхой организмын кодлогч генүүдээс бүрддэг геномын дэд хэсэг юм. Кодлох генүүд нь экзон гэж нэрлэгддэг ба мРНХ-д хөрвүүлэгдэж, дараа нь амин хүчлийн дараалалд шилждэг. Транскрипцийн дараах өөрчлөлтийн үед эукариотуудад РНХ залгах механизм интронуудыг (кодлогддоггүй бүс) зайлуулж, экзонууд үлддэг. Экзомын дараалал тогтоох хоёр үндсэн арга байдаг: шийдэлд суурилсан болон массив дээр суурилсан.
Уусмалд суурилсан экзомын дараалалд ДНХ-ийн дээжийг хязгаарлах фермент эсвэл механик аргаар хувааж, дулаанаар денатурат болгодог. Энэ техникт биотинжүүлсэн олигонуклеотидын зондуудыг (өгөөш) геномын зорилтот бүсүүдтэй сонгон эрлийзжүүлэхэд ашигладаг. Соронзон стрептавидины бөмбөлгүүдийг холбох шатанд ашигладаг. Холбогдсоны дараагаар угаалга хийх үе шат хийгдэж, холбоогүй болон онилсон бус дарааллыг угаана. Дараа нь холбогдох зорилтуудыг Полимеразын гинжин урвал (ПГУ) ашиглан олшруулж, дараа нь Sanger дараалал эсвэл Дараагийн үеийн дарааллын техникийг ашиглан дараалуулна.
Зураг 01: Эксомын дараалал
Масив дээр суурилсан арга нь мөн шийдэлд суурилсан аргатай төстэй бөгөөд зөвхөн ДНХ-ийн хэсгүүдийг микро массив болгон авч дарааллыг нь тогтоохын өмнө холбох болон угаах алхмуудыг хийдэг.
Экзомын дараалал нь өвчний генетикийн оношлогоо, генийн эмчилгээ, шинэ генетикийн маркеруудыг тодорхойлох, хөдөө аж ахуйд төрөл бүрийн ашигтай агрономийн шинж чанаруудыг тодорхойлох, ургамал үржүүлгийн журам зэрэг олон хэрэглээнд ашиглагддаг.
РНХ-ийн дараалал гэж юу вэ?
РНХ-ийн дараалал нь эсийн бүрэн хуулбар болох транскриптом дээр суурилдаг. РНХ-ийн дарааллын гол зорилго нь мРНХ, кодчилдоггүй РНХ, жижиг РНХ зэрэг бүх төрлийн транскриптийг каталогжуулах, генийн транскрипцийн бүтцийг тодорхойлох, хөгжлийн явцад транскрипт бүрийн илэрхийллийн түвшинг тодорхойлох явдал юм. РНХ-ийн дараалал тогтоох явцад эрлийзжүүлэх технологи (энэ нь боловсорч гүйцсэн мРНХ-ийн дарааллаас гаргаж авсан нэмэлт ДНХ байсан) дараалалд анх ашигласан. Одоогоор РНХ-ийн дараалал тогтооход илүү нарийвчлалтай, дэвшилтэт дамжуулагч техникийг ашиглаж байна.
Зураг 02: РНХ-ийн дараалал
РНХ-ийн дараалалд нийт РНХ эсвэл фракцлагдсан РНХ байж болох РНХ-ийн дээжийг урвуу транскрипцийг ашиглан нэмэлт ДНХ (cDNA) болгон хувиргаж, cDNA номын сан бэлтгэдэг. cDNA фрагмент бүрийг хоёр талдаа (хос төгсгөлийн дараалал) эсвэл нэг талдаа (нэг төгсгөлийн дараалал) адаптерт хавсаргасан байна. Эдгээр шошготой дарааллыг Sanger дараалал эсвэл дараагийн үе, жишээ нь экзомын дараалал ашиглан эрэмбэлсэн.
Эксом болон РНХ-ийн дараалал хоёрын ижил төстэй талууд юу вэ?
- Богино сонгосон фрагментууд эсвэл ДНХ / РНХ-ийн бүхэл бүтэн багцыг Эксом эсвэл РНХ-ийн дараалалд ашиглаж болно.
- Дараалсан фрагментүүд номын санд хадгалагдана.
- Sanger дараалал эсвэл Дараагийн үеийн дарааллыг ашиглаж болно.
- Хоёулаа in vitro дарааллын аргууд.
- Дараалсан хэсгүүдийг флюресцент хаягаар тодорхойлж болно.
Эксом болон РНХ-ийн дараалал хоёрын ялгаа юу вэ?
Эксом ба РНХ-ийн дараалал |
|
| Экзомын дараалал гэдэг нь организмд байгаа экзон буюу кодлогч ДНХ-ийн бүсүүдийн иж бүрэн дараалал юм. | РНХ-ийн дараалал гэдэг нь Рибонуклеины хүчлүүдийн (РНХ) дараалал тогтоох процедурыг хэлнэ; транскриптом. |
| Эхлэх жишээ | |
| Геномын ДНХ нь экзомын дарааллын эхлэл юм. | РНХ нь РНХ дарааллын эхлэлийн дээж юм. |
| Бүтэц | |
| Энэ нь зөвхөн Эксон гэгддэг нийт ДНХ-ийн кодлох хэсгүүдийг агуулна | Энэ нь РНХ-мРНХ / транскриптом агуулдаг. |
| Дараалал | |
| Эксомын дараалал тогтоох хоёр үндсэн арга байдаг; шийдэлд суурилсан болон массив дээр суурилсан технологиуд. | РНХ-ийн дараалал нь нийт РНХ эсвэл хуваагдсан РНХ-г задлах замаар cDNA номын сан бэлтгэх замаар хийгддэг. |
Хураангуй – Эксом ба РНХ-ийн дараалал
Экзом нь организмын кодлох бүсүүдийн иж бүрдэл бөгөөд Эксомын нуклеотидын яг дарааллыг тодорхойлоход оролцдог техникийг экзомын дараалал гэж нэрлэдэг. РНХ-ийн дараалал нь организмын РНХ-ийн нуклеотидын дарааллыг тодорхойлоход оролцдог техник юм. Энэ бол экзом болон РНХ-ийн дарааллын хоорондох ялгаа юм.
Exome ба РНХ-ийн дарааллын PDF хувилбарыг татаж авах
Та энэ нийтлэлийн PDF хувилбарыг татаж аваад офлайн зорилгоор ашиглах боломжтой. PDF хувилбарыг эндээс татаж авна уу Эксом ба РНХ-ийн дарааллын ялгаа
