Гол ялгаа – Эксом ба Транскриптом
Ген нь дотроо кодлох болон кодлохгүй бүсүүдийг агуулдаг. Кодлох дарааллыг экзон гэж нэрлэдэг ба кодчилдоггүй дарааллыг интрон гэж нэрлэдэг. Генийн экзонуудын нуклеотидын дараалал нь тодорхой уургийг нийлэгжүүлэх генийн генетик кодыг илэрхийлдэг. Тиймээс экзонууд мРНХ молекулд үлддэг. Геномын нийт экзон бүсийг экзом гэж нэрлэдэг бөгөөд энэ нь геномын чухал хэсэг юм. Генүүдийн генетик код нь уураг үйлдвэрлэхэд шаардлагатай мРНХ молекулын генетик код болж хувирдаг. Нэг удаад эс эсвэл эсийн популяцид хуулбарлагдсан мРНХ-ийн молекулуудыг бүхэлд нь транскриптом гэж нэрлэдэг. Экзом ба транскриптомын гол ялгаа нь экзом нь геномын экзон бүсүүдийн дарааллыг илэрхийлдэг бол транскриптом нь тухайн цаг үеийн эс эсвэл эд эсийн нийт мРНХ-ийг илэрхийлдэгт оршино.
Exome гэж юу вэ?
Генүүд нь экзон, интрон, зохицуулалтын дарааллаас бүрдэнэ. Экзонууд нь транскрипцийн явцад мРНХ-ийн дараалалд шилждэг генийн бүсүүд юм. Транскрипцийн явцад интрон болон бусад кодлогдоогүй бүсүүдийг устгадаг. Экзонуудын нуклеотидын дараалал нь түүний кодлодог тодорхой уургийг нийлэгжүүлдэг генийн генетик кодыг тодорхойлдог. Уургийн мРНХ дотор зөвхөн экзон үлддэг. Геном дахь экзонуудын цуглуулгыг организмын экзом гэж нэрлэдэг. Энэ нь генээр илэрхийлэгддэг геномын нэг хэсгийг төлөөлдөг. Хүний хувьд экзом нь геномын 1% -ийг эзэлдэг. Энэ нь хүний геномын уураг кодлох хэсэг юм.
Зураг 01: Эксом
Транскриптом гэж юу вэ?
Транскриптом гэдэг нь тухайн эд эс дэх уураг кодлодог болон кодлогддоггүй бүх транскрипт (РНХ)-ийн цуглуулга юм. Транскриптом нь эс эсвэл эд дэх генээр илэрхийлэгддэг нийт мРНХ молекулуудын цуглуулгыг илэрхийлдэг. Эсийн транскриптомыг өөр төрлийн эсийн транскриптомоор өөрчилж болно. Транскриптом нь мөн динамик бөгөөд энэ нь дотоод болон гадаад өдөөлтөд хариу үйлдэл үзүүлэхэд цаг хугацааны явцад өөрчлөгддөг. Нэг эд эс доторх нэг төрлийн эсийн дотор ч транскриптом хэдхэн минутын дараа өөрчлөгдөж болно.
Транскриптом нь организмын экзомоос ялгаатай. Транскриптом нь зөвхөн илэрхийлэгдсэн экзомын дарааллыг агуулдаг. Хэдийгээр эсийн экзом нь ижил хэвээр байгаа боловч генийн илэрхийлэл бүх эс, эдэд ижил байдаггүй тул транскриптом нь эсүүдэд өөр өөр байдаг. Зөвхөн зайлшгүй шаардлагатай генүүд нь өөр өөр эс, эдэд илэрдэг. Генийн илэрхийлэл нь эд эс эсвэл эсийн төрлийн тодорхой үйл явц юм. Энэ нь янз бүрийн хүчин зүйл, түүний дотор хүрээлэн буй орчны хүчин зүйлүүдээр зохицуулагддаг. Тиймээс транскриптом нь гадаад орчны нөхцөл байдлаас хамаарч өөр өөр байж болно.
Транскриптомыг протеомикийн судалгаанд урьдал материал болгон ашигладаг. Бүх уураг нь мРНХ-ийн дарааллаас гаралтай. Орчуулгын өөрчлөлт нь уургийн өөрчлөлтөд хүргэдэг. Гэсэн хэдий ч транскриптом нь протеомик судалгаанд чухал үндсэн мэдээллийг өгдөг.
Зураг 02: Үр хөврөлийн үүдэл эсийн транскриптом
Exome болон Transscriptome хоёрын ялгаа нь юу вэ?
Exome vs Transscriptome |
|
| Экзом нь генийн уураг кодлох хэсгийн цуглуулга юм. | Transcriptome нь мРНХ зэрэг бүх транскрипт РНХ-ийн цуглуулга юм. |
| Жишээ | |
| Эксомыг ДНХ-ийн дээж ашиглан судалдаг. | Транскриптомыг РНХ-ийн дээж ашиглан судалдаг. |
| Судлах арга | |
| Бүтэн экзомын дараалал нь экзомыг судлах арга юм. | РНХ-ийн дараалал нь транскриптомыг судлах арга юм. |
Хураангуй – Эксом ба Транскриптом
Эксонууд нь генийн кодлох дараалал бөгөөд уургийн мРНХ-ийн дарааллыг тодорхойлдог. Эдгээр кодчиллын дарааллын цуглуулгыг (эксон) организмын экзом гэж нэрлэдэг. Уураг үүсгэхээс өмнө генийг мРНХ молекул болгон хувиргадаг. Аливаа эс эсвэл эд эсийн нийт мРНХ молекулуудыг транскриптом гэж нэрлэдэг. Транскриптом нь ямар ч үед мРНХ-д идэвхтэй илэрхийлэгдэж буй генүүдийг төлөөлдөг. Транскриптом нь эс, эд эсийн өвөрмөц шинж чанартай бөгөөд хүрээлэн буй орчны нөхцөл байдалд нөлөөлдөг. Энэ бол экзом болон транскриптомын ялгаа юм.
