Шаталсан болон бүхэл геномын бууны дарааллын гол ялгаа нь шаталсан бууны дараалалд геномыг дараалалд оруулахаас өмнө илүү том хэсгүүдэд хуваадаг бол геномын бүхэл бүтэн бууны дараалалд бүхэл геномыг жижиг хэсгүүдэд хуваадаг..
Дараалал нь молекулын процесс, ялангуяа төрөл зүйлийг нарийн тодорхойлох чухал арга юм. Үнэн хэрэгтээ энэ нь ген эсвэл геном дахь нуклеотидын нарийн дарааллыг тодорхойлох арга юм. Дараалал тогтоох олон арга техник байдаг. Эдгээрийн заримд нь Максам Гилбертийн арга, Сангерын арга, автоматжуулсан Сангер арга зэрэг багтана.
Буудлагын шаталсан дараалал гэж юу вэ?
Шаталсан бууны дараалал нь дараалал тогтоох нэг арга юм. Үүнийг мөн "дээрээс доош дараалал" гэж нэрлэдэг. Цаашилбал, энэ арга нь хоёр үе шатаас бүрдэнэ: эхний алхам нь геномын олшруулалт, хоёр дахь шат нь геномын хуваагдал юм. Энэ аргын хувьд геномыг эхлээд том хэсгүүдэд хуваадаг. Дараа нь эдгээр том хэсгүүдийг векторууд эсвэл хиймэл хромосом ашиглан янз бүрийн хостуудад хувилах явдал юм. Дараа нь эдгээр рекомбинант векторуудыг номын санд байрлуулна. Бууны дараалал тогтоох явцад рекомбинант вектор клонууд тус тусад нь дараалалд ордог. Клон дахь хэлтэрхийнүүд нь геномын хэмжээг улам бүр багасгахын тулд задралын хязгаарлалтад хамрагдаж, улмаар дараалалд ордог.
Зураг 01: Шаталсан бууны дараалал
Бууны шаталсан дарааллын үед бууны бууны дарааллаас өмнө том хэсгүүдийг дарааллаар нь байрлуулах шаардлагатай. Энэ нь клончлох процесст орсон молекулын маркеруудын тусламжтайгаар явагддаг.
Бууны шаталсан дараалал нь бага нарийвчлалтай генийн зураглалыг үүсгэдэг. Гэхдээ энэ нь эрэмбэлэгдсэн дарааллын газрын зургийг үүсгэдэг. Тиймээс энэ нь шууд дарааллаас илүү урт хугацаа шаарддаг. Рекомбинант векторын санг бий болгосноор бүх процесс хойшлогдож байна. Бас хөдөлмөр их шаарддаг техник мөн үү. Гэсэн хэдий ч одоогоор ажлыг хөнгөвчлөхийн тулд техникийг автоматжуулсан байна.
Бүтэн геномын бууны дараалал гэж юу вэ?
Бүтэн геномын бууны дараалал нь нэг алхамтай дараалал тогтоох үйл явц юм. Энэ процесст эхлээд геномыг бүхэлд нь хяргах ажил явагдана. Үүний дараа эдгээр жижиг хэсгүүд бүр санамсаргүй байдлаар дараалалд ордог. Дараалалыг дуусгасны дараа дарааллын шинжилгээг хийнэ. Дарааллын шинжилгээний явцад давхцсан дарааллыг арилгадаг бөгөөд шинжилгээ нь эрэмбэлэгдсэн процесс биш юм. Тиймээс дараалал угсрах нь шаталсан бууны дараалалтай харьцуулахад үр ашиг багатай үйл явц юм. Гэсэн хэдий ч бүхэл бүтэн геномын бууны дараалал тогтоох үйл явц илүү хурдан бөгөөд бүхэл геномын шинжилгээг нэг удаа хийх боломжтой.
Шаталсан болон бүхэл геномын бууны дарааллын хооронд ямар төстэй зүйл байдаг вэ?
- Шаталсан болон бүхэл геномын бууны дараалал нь дараалал тогтоох хоёр арга юм.
- Хоёулаа Sanger дараалал эсвэл автомат Sanger дарааллын аргад хамрагддаг.
- Тэд ДНХ болон РНХ-ийн хэсгүүдийн дараалал тогтооход оролцдог.
- Түүнээс гадна, энэ хоёр арга нь молекулын оношлогоо, судалгааны зорилгоор чухал ач холбогдолтой.
- Одоогоор энэ хоёр техник нь автоматжуулсан эсвэл компьютерт суурилсан.
- Хоёр техник нь геномын хуваагдалд тулгуурладаг.
Шаталсан болон бүхэл геномын бууны дарааллын хооронд ямар ялгаа байдаг вэ?
Шаталсан бууны дараалал нь жижиг хэсгүүдтэй ажилладаг бүхэл геномын бууны дараалалтай харьцуулахад илүү том хэмжээтэй хэсгүүдийг үүсгэдэг. Тиймээс энэ бол шаталсан болон бүхэл бүтэн геномын бууны дарааллын гол ялгаа юм. Үүнээс гадна, шаталсан бууны дараалал нь хоёр үндсэн үе шатаас бүрддэг бол бүхэл бүтэн геномын бууны дараалал нь нэг гол алхам дээр тулгуурладаг.
Цаашилбал, шаталсан бууны дараалал болон бүхэл геномын бууны дарааллын өөр нэг ялгаа нь шаталсан бууны дараалалтай харьцуулахад бүхэл геномын бууны дарааллын нарийвчлал өндөр байдаг.
Доорх инфографик нь шаталсан болон бүхэл бүтэн геномын бууны дарааллын ялгааг нэгтгэн харуулав.
Хураангуй – Шаталсан ба бүхэл геномын бууны дараалал
Шаталсан болон бүхэл геномын бууны дараалал нь том геномуудыг дараалалд оруулах хоёр арга юм. Шаталсан бууны дараалал нь геномыг илүү том хэсгүүдэд хуваасан дарааллын хоёр үе шаттай үйл явц юм. Үүний эсрэгээр, бүхэл бүтэн геномын бууны дараалал нь геномыг жижиг хэсгүүдэд хувааж, шууд дараалалд оруулдаг нэг үе шаттай дараалал юм. Тиймээс энэ нь шаталсан болон бүхэл бүтэн геномын бууны дарааллын гол ялгаа юм. Түүнчлэн, техникийн тал нь хоёр техникээс хамаарч өөр өөр байж болно.
