Хадгалсан ба зөвшилцлийн дарааллын гол ялгаа нь хадгалагдсан дараалал гэдэг нь өөр өөр зүйл эсвэл ижил зүйлд үүсэлтэй ижил төрлийн нуклейн хүчлүүд эсвэл амин хүчлүүдийн ижил дарааллыг хэлдэг бол зөвшилцлийн дараалал нь ихэвчлэн тохиолддог нуклеотидын дараалал эсвэл олдсон амин хүчлийн дараалал юм. ДНХ эсвэл РНХ эсвэл уургийн өндөр хадгалагдсан бүсэд.
Организмууд ижил төстэй төдийгүй өөр шинж чанартай байдаг. Организмын хоорондын харилцааг судлах, тэдгээрийг ангилахдаа организмын геном буюу генетикийн бүтэц маш чухал байдаг. Янз бүрийн организмд нийтлэг байдаг нуклеотид эсвэл амин хүчлийн дараалал байдаг. Хадгалсан дараалал гэдэг нь төрөл зүйлийн дунд нийцсэн нуклейн хүчил эсвэл амин хүчлийн дараалал юм. Тиймээс тэдгээр нь филогенетик модыг бий болгоход филогенетикийн хувьд чухал ач холбогдолтой юм. Хадгалсан дараалалд нуклеотидын тусгай дараалал байдаг бөгөөд тэдгээр нь илүү түгээмэл байдаг. Тэдгээрийг зөвшилцлийн дараалал гэж нэрлэдэг.
Хадгалагдсан дараалал гэж юу вэ?
Хадгалсан дараалал нь төрөл зүйлийн дунд ижил төстэй нуклейн хүчлийн дараалал эсвэл амин хүчлийн дараалал юм. Тиймээс энэ нь хувьслын туршид төрөл зүйлийн хувьд тогтвортой байдаг. Ерөнхийдөө эдгээр дарааллыг байгалийн шалгарал хадгалдаг. Тэд филогенетикийн модноос хол зайд өөрчлөгдөөгүй хэвээр байна. Тиймээс хадгалагдсан дараалал нь филогенетик модыг бий болгоход чухал ач холбогдолтой юм. Өндөр хэмнэлттэй дараалал нь ихэвчлэн чухал функциональ үнэ цэнэтэй байдаг гэж үздэг. Эдгээр нь удамшлын өвчнийг тодорхойлоход тустай. Гэсэн хэдий ч хадгалагдсан дараалал нь нуклейн хүчлийн кодлогч эсвэл кодлогддоггүй дараалал байж болно. Үүнээс гадна хадгалагдсан дараалал нь мутацийн удаашралтай байгааг харуулж байна. Тиймээс тэд найрлагадаа маш бага өөрчлөлтийг харуулдаг; Заримдаа тэд үе үеийн өөрчлөлтийг харуулдаггүй.
Зураг 01: Хадгалсан дараалал
Рибосомын РНХ-ийн бүрдэл хэсгүүд нь амьдралын бүхий л салбарт байдаг, эукариотуудын гомеобокс дараалал, бактери дахь tmRNA нь өндөр хадгалагдсан дарааллын хэд хэдэн жишээ юм. Био-информатикийн арга барил, ялангуяа дарааллыг тохируулах хэрэгслийг ашиглах үед хадгалагдсан дарааллыг тодорхойлоход хялбар байдаг. Түүнчлэн, олон дарааллыг зэрэгцүүлэх нь хадгалагдсан дарааллыг дүрслэн харуулахыг хөнгөвчилдөг.
Зөвшилцлийн дараалал гэж юу вэ?
Зөвшилцлийн дараалал гэдэг нь ДНХ эсвэл РНХ-ийн хадгалагдсан бүс нутагт ихэвчлэн олддог дараалал юм. Энэ бол маш өвөрмөц нуклеотидын дараалал юм. Жишээ нь, E. coli промоторуудын TATAAT (Pribnow box) -10 дээр зөвшилцлийн дараалал байдаг бөгөөд эдгээр нь өндөр хадгалагдсан дараалал юм. Үүний нэгэн адил өөр нэг зөвшилцлийн дараалал байдаг: TTGACA нь E. coli дэмжигчид -35-д мөн. Зөвшилцлийн дарааллыг мөн "хайрцаг" гэж нэрлэдэг.
Зураг 02: Зөвшилцлийн дараалал
Уургууд нь ДНХ, РНХ-ээс гадна амин хүчлүүдийн нэгдсэн дараалалтай байдаг. Уураг холбох газруудыг ихэвчлэн зөвшилцлийн дарааллаар төлөөлдөг. Хязгаарлалтын ферментүүд нь зөвшилцлийн дараалалтай байдаг. Түүгээр ч барахгүй, залгах газрууд нь бас зөвшилцлийн дараалал юм. Хадгалсан дараалалтай адил зөвшилцлийн дарааллыг биоинформатик хэрэгслээр тооцоолж, дүрсэлж болно.
Хадгалсан ба зөвшилцлийн дарааллын хооронд ямар төстэй зүйл байдаг вэ?
- Хадгалсан ба зөвшилцсөн дараалал нь төрөл зүйлд түгээмэл байдаг нуклейн хүчил эсвэл амин хүчлүүдийн дараалал юм.
- Хадгалсан болон зөвшилцсөн дарааллыг биоинформатик хэрэгслээр дүрслэн харуулах боломжтой.
- Тэдгээрийг молекул биологид өргөн ашигладаг.
Хадгалсан ба зөвшилцлийн дарааллын хооронд ямар ялгаа байдаг вэ?
Хадгалсан дараалал нь нуклейн хүчил эсвэл амин хүчлийн дараалал бөгөөд төрөл зүйлийн дунд нийцдэг бол зөвшилцлийн дараалал нь тухайн хадгалагдсан бүс нутагт маш өвөрмөц бөгөөд түгээмэл олддог суурь эсвэл амин хүчлүүд юм. Тиймээс энэ нь хадгалагдсан ба зөвшилцлийн дарааллын хоорондох гол ялгаа юм. Түүнчлэн, хадгалагдсан ба зөвшилцлийн дарааллын өөр нэг ялгаа нь хадгалагдсан дараалал нь филогенетикийн хувьд чухал байдаг бол зөвшилцлийн дараалал нь ихэвчлэн уураг холбох газар, залгах газар, хязгаарлах ферментийг огтлох газар гэх мэт байдаг.
Товч мэдээлэл – Хадгалсан ба зөвшилцлийн дараалал
Хадгалсан дараалал гэдэг нь амьд зүйлийн дунд ижил төстэй нуклейн хүчлүүд эсвэл уургийн дараалал юм. Промотор, рибосомыг холбох газар, репликацийн гарал үүсэл, гистоны уургийн амин хүчлийн дараалал нь хадгалагдсан дарааллын хэд хэдэн жишээ юм. Үүний эсрэгээр, зөвшилцлийн дараалал нь тухайн хадгалагдсан дараалалд илүү түгээмэл байдаг тусгай суурь эсвэл амин хүчлүүд юм. -10 хайрцаг, -35 хайрцаг E. coli дэмжигч, уураг холбох газар, залгах газар, хязгаарлах ферментийг таних цэгүүд нь зөвшилцлийн дарааллын хэд хэдэн жишээ юм. Тиймээс энэ нь хадгалагдсан болон зөвшилцлийн дарааллын ялгааны хураангуй юм.