Зөвшилцсөн ПГУ ба Пан ПГУ-ын гол ялгаа нь зөвшилцсөн ПГУ нь үргэлж хамгаалагдсан бүс нутгуудад чиглэгддэг бол Пан ПГУ нь бүлгийн өөр өөр омгийг тодорхойлохын тулд хувьсах бүс нутгуудыг онилдог
Полимеразын гинжин урвал (ПГУ) нь генийг олшруулах арга бөгөөд денатураци, анялах, өргөтгөх гэсэн гурван үндсэн үе шатаас бүрддэг. Энэ нь оношилгоо, молекулыг тодорхойлоход өргөн хэрэглэгддэг. Зөвшилцлийн ПГУ болон Пан ПГУ-ын аргууд нь ПГУ-ын төрөл бүрийн ашигладаг праймер зорилтууд дээр суурилдаг.
Consensus PCR гэж юу вэ?
Зөвшилцлийн ПГУ нь тодорхой зүйл эсвэл удамшлын хувьд хамгаалагдсан бүс нутагт чиглэсэн ПГУ-ын арга юм. Тиймээс олшруулахын тулд өндөр хамгаалагдсан бүс нутгийг сонгосон. Энэ аргын тусламжтайгаар организмуудыг зөвшилцөлд тулгуурлан ялгаж, ялгах боломжтой. Энэ арга нь тодорхой зүйлийн хувьд хамгаалагдсан бүс нутгийг тодорхойлдог. Жишээлбэл, бактерийн 16s rRNA бүс нь бактерийн дунд хадгалагдсан бүс хэвээр байна. Тиймээс олшруулахад зөвхөн нэг праймерын багц шаардлагатай. Ихэнх тохиолдолд хамгаалагдсан бүсэд бүх нийтийн тусгай праймерыг ашиглаж болно.
Зураг 01: ПГУ-ын техник
Зөвшилцсөн ПГУ-ын аргыг баримталснаар зүйлийн шинж чанар, хувьслын хамаарлыг гаргаж болно. Тухайн түүвэр организмын олшруулалтын үр ашгийг үндэслэн тухайн бүлгийн талаархи организмын зөвшилцлийг гаргаж болно. Цаашилбал, зөвшилцсөн ПГУ-ыг хийх нь филогенетикийн судалгаанд амин чухал юм. Энэ нь төрөл зүйлийг тодорхойлох боломжийг олгодог бөгөөд тухайн организмын хазайлтыг нийтлэг өвөг дээдсийн хувьд тайлбарладаг.
Пан ПГУ гэж юу вэ?
Пан ПГУ нь ПГУ-ын олон талт горим юм. Энэ техникт янз бүрийн праймер зорилтуудыг ашиглан өөр өөр омог олшруулдаг. Гэсэн хэдий ч зорилтууд нь омгийн бүлгүүдийн нийтлэг зорилт байж болно. Тиймээс Пан ПГУ-д нэг удаад хоёроос дээш праймер багцыг ашиглаж болно. Энэ нь нэг хоолойт урвалын арга эсвэл олон хоолойт урвалын арга хэлбэрээр явагдах боломжтой. Пан ПГУ нь зөвшилцсөн ПГУ-тай харьцуулахад илүү их цаг хугацаа шаарддаг бөгөөд илүү төвөгтэй байдаг. Энэ шалтгааны улмаас Пан ПГУ-д ПГУ-ын үр дүнг тайлбарлах нь илүү төвөгтэй байж болно.
Пан ПГУ-ын гол хэрэглээ нь молекулын оношлогоо юм. Энэ нь зорилтот олшруулалтаар төрөл зүйлийн өөр өөр омгийг ялгах боломжийг олгодог. Пан ПГУ нь өвчин үүсгэдэг нэг зүйлийн өөр өөр омгийг тодорхойлох хамгийн тохиромжтой арга юм. Ихэнх тохиолдолд эрүүл мэндийн янз бүрийн нөхцөлд Пан ПГУ-ын техникийг автоматжуулах нь маш чухал бөгөөд найдвартай, өндөр үр ашигтай арга юм.
Зөвшилцлийн ПГУ болон Пан ПГУ-ын хооронд ямар төстэй зүйл байдаг вэ?
- Consensus PCR болон Pan PCR нь хоёр төрлийн ПГУ-ын арга юм.
- Энэ хоёр процедур нь денатураци, анялах, сунгах гэсэн гурван үе шаттай ерөнхий журмыг дагаж мөрддөг.
- Тэд тодорхой зорилтот праймер ашигладаг.
- Хоёр урвал нь дулааны мөчлөгт явагдана.
- Эдгээр хариу үйлдлийг автоматжуулж болно.
- Хоёуланг нь молекулын оношлогоо, таних ажилд ашиглах боломжтой; гэхдээ нарийвчлал өөр байна.
- Эдгээр процедур нь баталгаажуулалт шаарддаг.
Зөвшилцлийн ПГУ ба Пан ПГУ-ын ялгаа нь юу вэ?
Зөвшилцөл болон Пан ПГУ-ын аль аль нь ижил энгийн процедурыг дагаж мөрддөг. Гэсэн хэдий ч зөвшилцсөн ПГУ ба Пан ПГУ-ын гол ялгаа нь процедур бүрийн ашигладаг праймер зорилтод суурилдаг. Зөвшилцлийн ПГУ нь үргэлж хамгаалагдсан бүс нутгуудад чиглэгддэг бол Пан ПГУ нь бүлгийн өөр өөр омгийг тодорхойлохын тулд хувьсах бүс нутгуудыг онилдог. Энэ ялгааны улмаас праймерын загварчлалын протоколууд, ашигласан праймер багцын тоо болон тусгай програмууд өөр өөр байдаг.
Доорх инфографик нь Consensus PCR болон Pan PCR хоёрын ялгааг нэгтгэн харуулав.
Товч мэдээлэл – ПГУ-ын эсрэг ПГУ-ын зөвшилцөл
Муллигийн танилцуулсан ПГУ нь молекул биологийн хэрэглээнд хувьсгалт чухал үүрэг гүйцэтгэдэг. Consensus болон Pan PCR нь праймер зорилтот бүс нутгуудад суурилсан хоёр төрлийн ПГУ юм. Зөвшилцлийн ПГУ нь хамгаалагдсан бүс нутгуудад чиглэгддэг бол Пан ПГУ нь хувьсах бүс нутгуудад онилдог бөгөөд омог тодорхойлоход чухал үүрэг гүйцэтгэдэг. Зөвшилцсөн ПГУ ба Пан ПГУ-ын хоорондох үндсэн ялгаанаас шалтгаалан ПГУ-ын төрөл бүрийн онцлог функцууд нь филогенетикийн шинжилгээнээс молекулын шинж чанараас молекулын оношлогоо хүртэл өөр өөр байдаг.
