Праймер ба промотер хоёрын гол ялгаа нь праймер нь зорилтот ДНХ-ийн дарааллыг олшруулах зорилгоор ПГУ-д ашиглагддаг арилжааны хувьд богино ДНХ-ийн дараалал бөгөөд промотор нь РНХ-ийг найдвартай холбох цэгийг хангадаг тодорхой ДНХ-ийн дараалал юм. Транскрипцийг эхлүүлэхийн тулд полимераз ба транскрипцийн хүчин зүйлс.
Праймер ба промотер нь ДНХ-ийн хоёр төрлийн дараалал юм. Праймер нь полимеразын гинжин урвал (ПГУ) хийхэд шаардлагатай ДНХ-ийн жижиг хэсэг юм. Энэ нь ДНХ-ийн хэлхээний хажуугийн төгсгөлд нэмэлт богино нуклеотидын дараалалтай байдаг. Хоёр төрлийн праймер байдаг бөгөөд тэдгээр нь ДНХ-ийн шинэ хэлхээний нийлэгжилтийн эхлэлийн цэг болдог. Үүний эсрэгээр, промотор нь генийн транскрипцийг эхлүүлэх цэгээс дээш чиглэсэн ДНХ-ийн тодорхой дараалал юм. Энэ нь ДНХ-ийн транскрипцийг хянахын тулд РНХ полимераз ба транскрипцийн хүчин зүйл зэрэг транскрипцийн механизмын бүрэлдэхүүн хэсгүүдтэй шууд харьцдаг. Тиймээс РНХ полимераз болон бусад транскрипцийн хүчин зүйлүүд нь промоторын дараалалд холбогдож, транскрипцийг эхлүүлдэг.
Праймер гэж юу вэ?
Праймерууд нь зорилтот ДНХ-ийн дарааллыг олшруулах зориулалттай богино ДНХ-ийн дараалал юм. Бүтцийн хувьд тэд ДНХ-ийн давхар хэлхээний хажуугийн төгсгөлд нэмэлт богино нуклеотидын дарааллыг эзэмшдэг. Тэдгээр нь ихэвчлэн 20 орчим нуклеотидын урттай байдаг. ПГУ-ын үед Так полимераз нь нуклеотидын урьд өмнө байгаа нуклеотидын дараалалд нэмэлтийг идэвхжүүлдэг. Тиймээс праймерууд нь шинэ хэлхээний синтезийн эхлэлийн цэг болдог. Так полимераз нь зөвхөн 5'-аас 3' чиглэлд ажилладаг. Тиймээс ДНХ-ийн нийлэгжилт нь мөн адил 5'-аас 3' чиглэлд явагддаг. ДНХ нь давхар судалтай тул ПГУ-д хоёр төрлийн праймер хэрэгтэй. Тэдгээрийг ДНХ-ийн нийлэгжилтийн үед праймерын суналтын чиглэлд тулгуурлан урагшлах праймер ба урвуу праймер гэж нэрлэдэг.
Зураг 01: Праймер
Урагшаа праймер нь антисенс ДНХ-ийн хэлхээтэй болж, генийн + хэлхээний нийлэгжилтийг 5'-аас 3' чиглэлд эхлүүлнэ. Энэ нь богино нуклеотидын дараалалтай бөгөөд энэ нь антисенс хэлхээний 3' хажуугийн төгсгөлд нэмэлт юм. Урвуу праймер нь мэдрэхүйн хэлхээтэй холбогдож, кодлох хэлхээний нэмэлт хэлхээний нийлэгжилтийг эхлүүлдэг бөгөөд энэ нь генийн хэлхээ нь 5'-3' чиглэлд хуваагддаг. Тиймээс урвуу праймер нь кодчиллын хэлхээний 3' төгсгөлд нэмэлт байдлаар бүтээгдсэн. Урвуу болон урагшлах праймерууд нь зорилтот эсвэл сонирхож буй ДНХ-ийн тодорхой хэсгийг сая, тэрбум хувь үйлдвэрлэхэд чухал үүрэгтэй.
Promoter гэж юу вэ?
Промотор нь генийн транскрипцийг эхлүүлсэн хэсгийн дээд буюу 5′ төгсгөлд байрлах ДНХ-ийн дараалал юм. Энэ нь генийн транскрипцийг эхлүүлэхийн тулд РНХ полимераз болон зарим зохицуулалтын элементүүдийг холбох газрыг хангадаг. Энэ нь генийг асаах, унтраахад шаардлагатай зохицуулалтын дараалал юм. Промоторт нуклеотидын тодорхой дараалал байдаг. Энэ нь 100-1000 үндсэн хостой байж болно. Промоутер нь транскрипцийн чиглэлийг харуулдаг. Түүнчлэн, энэ нь хөрвүүлэх ёстой мэдрэхүйн хэлхээг заана.
Зураг 02: Генийг дэмжигч
Нөмрөг дэмжигч, проксимал дэмжигч, дистал дэмжигч гэсэн гурван төрлийн дэмжигч элемент байдаг. Үндсэн дэмжигч нь транскрипцийг эхлүүлэхэд шаардагдах хамгийн бага хэсэг юм. Энэ нь эхлэл кодонтой хамгийн ойрхон байрладаг. TATA хайрцаг нь олон эукариот цөм дэмжигчид байдаг хадгалагдсан бүс юм. Энэ нь транскрипц эхлэх газраас 25-35 суурь хосоос дээш байдаг. Проксимал дэмжигч нь үндсэн промотороос дээш урсгалтай байдаг. Ерөнхийдөө энэ нь эхлэл кодоноос дээш 250 суурь хос зайд байрладаг бөгөөд анхдагч зохицуулалтын элементүүдийг агуулдаг. Алслагдсан промотор нь проксимал дэмжигчээс дээш байдаг бөгөөд энэ нь нэмэлт зохицуулалтын элементүүдийг агуулдаг. Бактерийн өдөөгч нь дэмжигчдээ хоёр богино дарааллын элементтэй байдаг. TATAAT нь бактерийн дэмжигчийн -10-д байрлах зөвшилцлийн дараалал, харин TTGACA нь -35-ын зөвшилцлийн дараалал юм. Тэдгээрийг -10 элемент ба -35 элемент гэж нэрлэдэг.
Праймер болон Промотер хоёрын ижил төстэй зүйл юу вэ?
- Праймер болон дэмжигч нь ДНХ-ийн хоёр төрлийн дараалал юм.
- Тэд нуклеотидын дарааллаас тогтдог.
- Праймер болон дэмжигч хоёулаа генийн илэрхийлэлд чухал үүрэгтэй.
Праймер болон Промотер хоёрын ялгаа юу вэ?
Праймер нь зорилтот ДНХ-ийг олшруулахад зориулагдсан богино нуклеотидын дараалал юм. Үүний эсрэгээр, дэмжигч нь генийн транскрипцийг эхлүүлэх цэгээс дээш чиглэсэн тодорхой зохицуулалтын ДНХ-ийн дараалал юм. Тиймээс энэ бол праймер ба дэмжигчийн хоорондох гол ялгаа юм. Праймерууд нь ойролцоогоор 20 үндсэн хос урттай байдаг бол промотерууд нь 100-1000 үндсэн хостой байж болно. Функциональ хувьд праймерууд шинэ хэлхээний синтезийн эхлэлийн дараалал болж үйлчилдэг бол промоторууд нь РНХ полимераз болон бусад транскрипцийн хүчин зүйлсийг холбох газруудаар хангаж генийн транскрипцийг хянадаг.
Түүгээр ч зогсохгүй промоторыг транскрипцийн чиглэл гэж тодорхойлж, генийн мэдрэхүйн хэлхээг заадаг. Бүтцийн хувьд праймер нь богино, нэг хэлхээтэй ДНХ-ийн дараалал, харин промотер нь урт хоёр хэлхээтэй ДНХ-ийн дараалал юм.
Доорх мэдээллийн графикт праймер болон дэмжигчийн ялгаатай холбоотой илүү олон харьцуулалтыг харуулсан болно.
Хураангуй – Праймер ба Сурталчлагч
Праймерууд нь зорилтот ДНХ-ийн давхар хэлхээний хажуугийн үзүүрүүдийг нөхдөг богино нуклеотидын дараалал юм. ПГУ-д хоёр төрлийн праймерыг ашигладаг. Эдгээр нь шинэ хэлхээний синтезийн эхлэлийн дараалал болдог. Праймерууд нь арилжааны зориулалтаар хийгдсэн бөгөөд тэдгээр нь температурын тогтвортой дараалал юм. Нөгөөтэйгүүр, дэмжигч нь транскрипцийг эхлүүлэх цэгээс дээш чиглэсэн генийн зохицуулалтын дараалал юм. Промоторууд генийн транскрипцийг хянадаг. Тэд транскрипцийг эхлүүлэхийн тулд РНХ полимераз ба транскрипцийн хүчин зүйлсийг холбох газруудыг хангадаг. Тиймээс энэ бол праймер болон дэмжигчийн ялгааны хураангуй юм.
