ITS1 болон ITS2-ын гол ялгаа нь ITS1 нь эукариотуудын 18S ба 5.8S рРНХ генүүдийн хооронд байрлах зайны ДНХ, харин ITS2 нь эукариотуудад 5.8S ба 28S рРНХ генийн хооронд байрлах зайны ДНХ юм.
Internal transcribed spacer (ITS) нь ихэвчлэн хромосом дахь жижиг дэд нэгж рибосомын РНХ болон том дэд нэгж рибосомын РНХ генүүдийн хооронд эсвэл полицистрон рРНХ-ийн урьдал транскрипт молекул дахь харгалзах транскрипжлэгдсэн бүсэд байрладаг зайны ДНХ юм. Бактери ба архейд 16S ба 23S рРНХ генийн хооронд зөвхөн ганц ITS байдаг. Харин эукариотуудад ITS-ийн хоёр зайны ДНХ байдаг: ITS1 (18S ба 5.8S rRNA генүүд) ба ITS2 (5.8S ба 28S rRNA хооронд). Тиймээс ITS1 болон ITS2 нь эукариотуудын рРНХ генүүдийн хооронд олдсон хоёр зайны ДНХ юм.
ITS1 гэж юу вэ?
ITS1 нь эукариотуудын 18S ба 5.8S рРНХ генийн хооронд байрлах зайны ДНХ юм. ITS гэдэг нь рРНХ генүүдийн хооронд байрлах функциональ бус зайны ДНХ-ийн хэсгийг хэлнэ. ITS1 нь ITS2-ээс илүү урттай. ITS1-ийн уртын өөрчлөлт нь ойролцоогоор (200-300bp) байна. ITS1 гэх мэт ITS маркерууд нь өөр өөр таксонуудын филогенетик харилцааг тодруулахад үр дүнтэй болохыг баталсан. Түүнчлэн, ITS1 spacer ДНХ нь ITS2 spacer ДНХ-ээс бага хадгалагддаг. ITS1 бүтэц нь зөвхөн илүү жижиг ангилал зүйн нэгжүүдэд хадгалагддаг. Эукариот рибосомын бөөгнөрөл бүр нь мөн гадаад транскриптийн зай (5’ ба 3’ ETS) гэж нэрлэгддэг мужуудыг агуулдаг.
Зураг 01: ITS1 бүс
ITS1 зайны ДНХ нь 5'гадаад транскрипц хийсэн зайтай (5' ETS) маш ойрхон байна. Цаашилбал, хэрэв хэн нэгэн филогенетик харилцааны судалгаанд зориулж ITS1 бүсийг нэмэгдүүлэхийг хүсвэл энэ зорилгоор тусгай праймер хос (урвуу ба урагшлах праймер) ашиглах ёстой. ITS1 бүсийг нэмэгдүүлэхийн тулд лабораторийн ПГУ-ын протоколд хоёр праймер багцыг ихэвчлэн ашигладаг. Эдгээр нь ITS1 урагш, ITS2 урвуу эсвэл ITS1 урагш, ITS4 урвуу.
ITS2 гэж юу вэ?
ITS2 нь эукариотуудын 5.8S ба 28S рРНХ генийн хооронд байрлах зайны ДНХ юм. ITS2 бүс нь ITS1 бүсээс богино урттай. ITS2-ийн уртын өөрчлөлт нь ойролцоогоор (180-240bp) байна. Гэсэн хэдий ч ITS2 бүс нь ITS1 бүсээс илүү олон ангиллын нэгжид хадгалагдан үлддэг. Энэ нь бүх ITS2 дараалал нь хоёрдогч бүтцийн нийтлэг цөмийг хуваалцдаг болохыг тодорхойлдог. Түүнчлэн, ITS2 бүс нутгийн 40% нь бүх ангиоспермүүдийн дунд хадгалагдаж байгаа бол ITS2 бүсийн 50% -ийг гэр бүл болон түүнээс дээш түвшинд нэгтгэх боломжтой.
Зураг 02: ITS2 бүс
Хамгаалалтын хамрах хүрээнээс үл хамааран ITS2 бүсийг филогенетик харилцааны судалгаанд, ялангуяа мөөгөнцрийн ДНХ-ийн бар кодчилолд ITS1 бүс гэх мэт маш их ашигладаг. ITS2 бүсийг нэмэгдүүлэхийн тулд лабораторийн ПГУ-ын протоколд тусгай праймер багцыг ихэвчлэн ашигладаг. Энэ нь ITS1 урагш, ITS4 урвуу. Гэхдээ ПГУ-ын протокол нь энэхүү праймер багцыг ашиглах үед ITS1 мужийг ITS2 бүстэй хамт олшруулдаг. Цаашилбал, ITS2 зайны ДНХ нь 3’гадаад транскрипц хийсэн зайтай (3' ETS) маш ойрхон байна.
ITS1 болон ITS2-н ижил төстэй байдал
- ITS1 болон ITS2 нь рРНХ генүүдийн хооронд байрлах хоёр зайны ДНХ юм.
- Тэдгээр нь зөвхөн эукариотуудад байдаг.
- Тодорхой хос праймер ашиглан хоёуланг нь өсгөж болно.
- Тэд хоёулаа рРНХ боловсорч гүйцсэн үед үйл ажиллагааны бус дайвар бүтээгдэхүүн болгон хасагддаг.
- Хоёулаа филогенетикийн хамаарлыг судлах, ялангуяа мөөгөнцрийн ДНХ-ийн бар кодлоход маш чухал.
ITS1 болон ITS2-ын ялгаа
ITS1 нь эукариотуудад 18S ба 5.8S рРНХ генийн хооронд орших зайны ДНХ бөгөөд ITS2 нь эукариотуудад 5.8S ба 28S рРНХ генийн хооронд байрлах зайны ДНХ юм. Тэгэхээр энэ нь ITS1 ба ITS2 хоёрын гол ялгаа юм. Цаашилбал, ITS1 нь ITS2-тэй харьцуулахад илүү урттай. Нөгөөтэйгүүр, ITS2 нь ITS1-тэй харьцуулахад богино урттай байдаг. Энэ нь ITS1 болон ITS2 хоёрын өөр нэг ялгаа юм.
Доорх инфографик нь ITS1 болон ITS2-ын ялгааг хүснэгт хэлбэрээр жагсааж, зэрэгцүүлэн харьцуулсан болно.
Хураангуй – ITS1 ба ITS2
Дотоод транскрипжлэгдсэн бүс (ITS) нь рРНХ генүүдийн хооронд байрлах зайны ДНХ-ийн функциональ бус хэсэг юм. Бактери ба архейд зөвхөн ганц ITS бүс байдаг. Гэхдээ эукариотуудад ITS1 ба ITS2 гэсэн хоёр ITS бүс байдаг. ITS1 нь эукариотуудад 18S ба 5.8S рРНХ генийн хооронд байрлах зайны ДНХ бөгөөд ITS2 нь эукариотуудад 5.8S ба 28S рРНХ генийн хооронд байрладаг зайны ДНХ юм. Энэ бол ITS1 болон ITS2-ын ялгааны хураангуй юм.
