Агароз ба полиакриламидын гель электрофорезын гол ялгаа нь агароз гель электрофорез нь ДНХ-ийн харьцангуй том хэсгүүдийг ялгахад хэвтээ цутгасан агароз гелийг ашигладаг бол полиакриламид гель электрофорез нь богино нуклетик хүчлийг ялгахын тулд босоо цутгасан полиакриламидын гелийг ашигладаг.
Электрофорез нь ДНХ, РНХ, уураг зэрэг биомолекулуудыг салгахын тулд гель матрицаар дамждаг цахилгаан талбайг ашигладаг нэг төрлийн арга юм. ДНХ, РНХ, уураг зэрэг биомолекулуудыг электрофорезээр ялгах нь цэнэг, хэмжээнээс хамаарна. Дээжийг гельний нүхэнд ачдаг. Дараа нь цахилгаан талбарыг гель даяар хэрэглэнэ. Талбай нь сөрөг цэнэгтэй молекулуудыг эерэг электрод руу шилжүүлэхэд хүргэдэг. Гель матриц нь молекул шигшүүр болж, хамгийн жижиг молекулууд хурдан дамждаг бол том молекулууд удаан хөдөлдөг. Энэ нь цэнэг, хэмжээнээс хамааран молекулуудыг салгах боломжийг олгодог. Тиймээс агароз ба полиакриламид гель электрофорез нь молекулуудыг хэмжээ, цэнэгээс нь хамааруулан ялгахад голлон тусалдаг гель электрофорезын хоёр төрлийн арга юм.
Агароз гель электрофорез гэж юу вэ?
Агароз гель электрофорез нь агароз гелийг ашиглан ДНХ, РНХ зэрэг биомолекулуудыг ялгах арга юм. Энэ нь нуклейн хүчлийг голчлон хэмжээгээр нь ялгахад ашигладаг арга юм. Энэхүү техникт ашигласан агароз гэж нэрлэгддэг гол нэгдэл нь полисахарид юм. Энэ нь далайн ургамлаас гаралтай. Агарозыг буцалж буй буферт уусгаж, дараа нь хэвтээ байрлалтай тавиур руу цутгаж болно. Тавиурт, энэ нь хавтан үүсгэхийн тулд хөргөхөд хатуурдаг. Агароз гелийг самаар цутгаж, гель хатуурсны дараа ДНХ эсвэл РНХ зэрэг нуклейн хүчлийг дүүргэх нүх гаргадаг.
Зураг 01: Агароз гель электрофорез
Гельийг дараа нь тохирох буферт дүрж, гель дээгүүр гүйдэл хийнэ. ДНХ нь молекулын дарааллын найрлагаас хамааралгүй жигд сөрөг цэнэгтэй байдаг. Тиймээс ДНХ молекулууд катодоос (-) анод руу (+) шилжинэ. Шилжилтийн хурд нь молекулын хэмжээнээс шууд хамаардаг. Хамгийн том макромолекулууд гельээр дамжин өнгөрөхөд хамгийн хэцүү байдаг. Нөгөөтэйгүүр, жижиг макромолекулууд гельээр хурдан бөгөөд амархан гулсдаг.
Полиакриламид гель электрофорез гэж юу вэ?
Полиакриламидын гель электрофорез (PAGE) нь биомолекулуудыг ялгахын тулд полиакриламидын гель ашигладаг арга юм. Энэ нь биологийн макромолекулууд, ихэвчлэн уураг, нуклейн хүчлүүдийг электрофорезийн хөдөлгөөнөөр нь ялгахад өргөн хэрэглэгддэг техник юм. Акрилонитрилийн усжилтын үр дүнд нитрил гидратазаар акриламидын молекулууд үүсдэг. Акриламид нь усанд уусдаг бөгөөд чөлөөт радикал үүсгэгчийг нэмснээр акриламид полимержиж, улмаар полиакриламидын гель үүсдэг. Ихэвчлэн акриламидын концентраци ихсэх нь гель дэх нүх сүвний хэмжээ багасдаг. Полиакриламид гель нь агароз гелээс ялгаатай нь босоо байдлаар цутгадаг.
Зураг 02: Полиакриламид гель электрофорез
Полиакриламидын гель электрофорезийн үед молекулууд нь төрөлх төлөв байдалд нь ажиллаж, молекулуудын дээд эрэмбийн бүтцийг хадгалдаг. Энэ аргыг эх PAGE гэж нэрлэдэг. Мөн дээд эрэмбийн бүтцийг устгаж, хөдөлгөөн нь зөвхөн уртаас нь хамаардаг бүтэцгүй молекул болгон хувиргах химийн денатурант нэмж болно. Энэ төрлийг SDS-PAGE гэж нэрлэдэг.
Агароз ба полиакриламидын гель электрофорез хоёрын ижил төстэй зүйл юу вэ?
- Агароз ба полиакриламид гель электрофорез нь гель электрофорезийн хоёр төрлийн арга юм.
- Үнэндээ эдгээр нь молекул биологийн техник юм.
- Хоёр аргыг ДНХ болон уураг зэрэг биологийн макромолекулуудыг илрүүлэхэд ашигладаг.
- Эдгээр техникийг чадварлаг техникч эсвэл судлаачид хийдэг.
- Хоёр аргын хувьд макромолекулуудыг ялгах нь цэнэг болон хэмжээн дээр суурилдаг.
- Хоёр техник нь ДНХ, РНХ зэрэг нуклейн хүчлүүдийг салгах боломжийг олгодог.
Агароз ба полиакриламид гель электрофорез хоёрын ялгаа юу вэ?
Агароз гель электрофорез нь биомолекулыг ялгахын тулд хэвтээ цутгасан агароз гель ашигладаг бол полиакриламид гель электрофорез нь босоо цутгасан полиакриламидын гелийг ашиглан биомолекулыг ялгах арга юм. Энэ бол агароз ба полиакриламидын гель электрофорез хоёрын гол ялгаа юм. Цаашилбал, агароз гель электрофорез нь ДНХ ба РНХ-ийг салгахад ашигладаг бол полиакриламид гель электрофорез нь ДНХ, РНХ эсвэл уураг зэрэг нуклейн хүчлийг ялгахад ашиглагддаг.
Дараах хүснэгтэд агароз ба полиакриламид гель электрофорезийн ялгааг нэгтгэн харуулав.
Хураангуй – Агароз ба Полиакриламид гель электрофорез
Агароз ба полиакриламид гель электрофорез нь молекул биологийн лабораторид хэрэглэгддэг хоёр төрлийн гель электрофорезийн арга юм. Агароз гель электрофорез нь биомолекулуудыг ялгахад агароз гель ашигладаг. Агароз нь хүний хувьд ерөнхийдөө хоргүй, харин полиакриламид нь хүний хувьд хортой байдаг. Түүнээс гадна агароз гель электрофорез нь бага нарийвчлалтай, полиакриламид гель электрофорез нь илүү нарийвчлалтай байдаг. Полиакриламидын гель электрофорез нь биомолекулуудыг ялгахын тулд полиакриламидын гель ашигладаг. Энэ нь агароз ба полиакриламидын гель электрофорез хоёрын ялгааг нэгтгэн харуулав
