ШУГАМ ба SINE-ийн гол ялгаа нь ШУГАМ (урт завсарласан цөмийн элементүүд) нь LTR бус урт ретротранспозонуудын нэг төрөл бөгөөд SINE (богино завсарласан цөмийн элементүүд) нь LTR бус ретротранспозонуудын нэг төрөл юм.
LTR бус ретротранспозонууд нь урт терминалын давталтуудыг (LTR) агуулдаггүй. Гэсэн хэдий ч тэдгээр нь урвуу транскриптаза, РНХ холбогч уураг, нуклеаз, рибонуклеаз H домэйны генийг агуулдаг. LTR бус ретротранспозонууд нь богино давталттай байдаг. Эдгээр давталтууд нь бие биенийхээ хажууд урвуу дараалалтай суурийн дараалалтай байна. Үүнээс гадна LTR бус ретротранспозонууд нь LRT транспозонуудад шууд давталттай байдаг. LTR бус ретротранспозонууд нь LINEs болон SINE гэсэн хоёр ангилалд хуваагдана.
МӨРӨӨ гэж юу вэ?
ШУГАМ (урт огтлолцсон цөмийн элементүүд) нь LTR бус илүү урт ретротранспозонууд юм. Эдгээр нь эукариотуудын геномд өргөн тархсан байдаг. Тэд ихэвчлэн хүний геномын 21.1% -ийг бүрдүүлдэг. Шугам бүр нь ойролцоогоор 7000 үндсэн хос урттай. Шугамууд нь мРНХ-д хувирч, урвуу транскриптазын ферментийн үүрэг гүйцэтгэх чадвартай уураг болгон хувиргаж чаддаг. Энэхүү урвуу транскриптаза нь LINEs RNA-ийн ДНХ хуулбарыг үүсгэдэг. Эдгээр ДНХ-ийн хуулбарыг шинэ сайт дээр геномд нэгтгэх боломжтой.
Зураг 01: Шугам ба SINE
Хүний геномд ШУГАМ-1 гэж нэрлэгддэг ганцхан элбэг мөр байдаг. LINE-1 элемент нь ойролцоогоор 6000 үндсэн хос урттай. Хүний геномд 100,000 орчим таслагдсан LINE-1 элемент байдаг. LINE-д санамсаргүй мутаци үүсч болно. Санамсаргүй мутацийн улмаас шугамууд муудаж болно. Тэдгээрийг хуулбарлах, орчуулахаа больсон. Цаашилбал, LINEs нь L1, RTE, R2, I, jockey зэрэг таван үндсэн бүлэгт хуваагддаг. Эдгээр таван бүлэг нь өөр 28 бүлэгт хуваагдана.
ШУГАМ нь ихэвчлэн зорилтот суурьтай урвуу транскрипцийн механизм (TPRT) гэж нэрлэгддэг механизмаар дамждаг. Шугам оруулах нь хүний гемофили А, хорт хавдар, менделийн эмгэг гэх мэт өвчин үүсгэдэг. Шугамын гипометиляци нь зарим төрлийн хорт хавдрыг мөн өдөөдөг.
SINE гэж юу вэ?
SINE (богино завсарласан цөмийн элементүүд) нь хамаагүй богино LTR бус ретротранспозонуудын нэг төрөл юм. Тэдгээр нь ойролцоогоор 100-700 үндсэн хос урттай байдаг. SINE нь мөн РНХ-ийн завсрын бүтээгдэхүүнээр дамжуулан эукариот геномуудад өөрсдийгөө олшруулдаг ДНХ-ийн элементүүд юм. SINE нь хөхтөн амьтдын геномын 13 орчим хувийг бүрдүүлдэг. SINE-ийн дотоод бүсүүд нь тРНХ-ээс үүсдэг. Энэ нь маш их хадгалагдсан хэвээр байна. Эдгээр нь ихэвчлэн олон төрлийн сээр нуруутан, сээр нуруугүй амьтдад байдаг. Зүйлүүдийн филогенезид суурилсан ангиллыг бий болгохын тулд SINE-ийн хуулбарын тооны хэлбэлзэл, мутацийг нэгтгэж болно.
SINE-ийг үндсэн гурван төрөлд бүлэглэж болно: CORE-SINEs, V-SINEs, AmnSINEs. Alu элемент нь приматуудын хамгийн түгээмэл SINE юм. Түүгээр ч зогсохгүй SINE-ийг оруулахтай холбоотой 50 гаруй хүний өвчин байдаг. Тэдгээрийг экзон дотор эсвэл ойролцоо оруулах үед тэдгээр нь буруу залгах эсвэл унших хүрээг өөрчлөхөд хүргэдэг. Энэ нь хөхний хорт хавдар, бүдүүн гэдэсний хорт хавдар, лейкеми, гемофили, цистик фиброз, бүдүүн гэдэсний хорт хавдар, Дентийн өвчин, нейрофиброматоз гэх мэт өвчний фенотипүүдэд хүргэдэг.
ШУГАМ болон SINE-ын хооронд ямар төстэй зүйл байдаг вэ?
- LINEs болон SINE нь хоёр төрлийн LTR бус ретротранспозон юм.
- Хоёуланд урт терминалын бүс (LTR) байхгүй.
- Хоёулаа ихэвчлэн зөвхөн эукариотуудад байдаг.
- Тэд хоёулаа бие даасан бус.
ШУГАМ болон SINE-ийн ялгаа нь юу вэ?
LINE нь урт LTR биш ретротранспозонууд байдаг бол SINE нь LTR бус ретротранспозонуудаас хамаагүй богино байдаг. Тиймээс энэ нь LINE болон SINE-ийн гол ялгаа юм. Цаашилбал, LINES нь урвуу транскриптаза ферментийг кодлодог бол SINE нь урвуу транскриптаза ферментийг кодлодоггүй. Тиймээс энэ нь LINE болон SINE хоёрын өөр нэг ялгаа юм.
ШУГАМ болон SINE-ийн хоорондох бусад ялгааг доор жагсаасан хүснэгт хэлбэрээр зэрэгцүүлэн харьцуулсан болно.
Хураангуй – LINEs ба SINEs
Ретротранспозонууд голчлон бүх эукариотуудад байдаг боловч прокариотуудад байдаггүй. Хүний геномын 37 орчим хувь нь ретротранспозон агуулдаг. Ретротранспозонууд нь үндсэндээ хоёр төрөл байдаг: LTR ба LTR бус ретротранспозонууд. LTR бус ретротранспозонууд нь LTR ретротранспозонуудад байдаг урт төгсгөлийн давталтуудыг (LTR) агуулдаггүй. LTR бус ретротранспозонуудыг LINEs ба SINE гэсэн хоёр ангилалд хуваадаг. LINEs нь LTR бус ретротранспозонууд илүү урт байдаг бол SINE нь LTR бус ретротранспозонуудаас хамаагүй богино байдаг. Тиймээс энэ нь LINE болон SINE-ийн ялгааны хураангуй юм.
