EcoRI болон HindIII хязгаарлалтын ферментүүдийн гол ялгаа нь EcoRI нь E. coli-аас тусгаарлагдсан II хэлбэрийн хязгаарлалтын фермент бол HindIII нь Haemophilus influenza-аас тусгаарлагдсан II хэлбэрийн хязгаарлалтын фермент юм.
Хязгаарлалтын фермент буюу хязгаарлах эндонуклеаз нь ДНХ-ийн молекул доторх тодорхой таних газруудад (хязгаарлалтын цэгүүд) ДНХ-г хэсэг болгон задалдаг фермент юм. Эдгээр хязгаарлалтын ферментүүд нь бактери, археид байдаг. Тэд вирусын эсрэг хамгаалалтын механизмыг бий болгодог. Хязгаарлалтын ферментийг ерөнхийд нь I төрөл, II төрөл, III, IV, V төрөл гэсэн таван төрөлд ангилдаг. EcoRI болон HindIII нь хязгаарлалтын 2 ферментийн бүлэгт хамаарах хоёр фермент юм.
EcoRI хязгаарлах фермент гэж юу вэ?
EcoRI нь E.coli-ийн зүйлээс тусгаарлагдсан II хэлбэрийн хязгаарлалтын фермент юм. Энэ нь ДНХ-ийн давхар мушгиауудыг тодорхой газруудад хэсгүүдэд хуваадаг хязгаарлалтын фермент юм. EcoRI нь хязгаарлалтын өөрчлөлтийн системийн нэг хэсэг юм. EcoRI нь E. coli төрлийн RY13 омогоос анх тусгаарлагдсан анхны фермент байв. Энэ нь молекул биологийн хязгаарлалтын фермент болгон ашиглагддаг. EcoRI нь 4 нуклеотидын наалдамхай үзүүрийг AATT-ийн 5' төгсгөлтэй хэт их хэмжээгээр үүсгэдэг. EcoRI нь ДНХ-г G↓AATTC таних тодорхой дарааллаар таслана. Энэ нь CTTAA↓G-ийн палиндромик нэмэлт дараалалтай. Түүнээс гадна энэхүү хязгаарлах фермент нь II төрлийн P (палиндром өвөрмөц чанар) дэд ангилалд багтдаг. Үндсэн бүтцээрээ EcoRI нь бусад хязгаарлагч ферментүүдийн нэгэн адил идэвхтэй хэсэгтээ PD. D/EXK сэдлийг агуулдаг.
Зураг 01: EcoRI
EcoRI хязгаарлах фермент нь 31 кДа-ийн гомодимер юм. Энэ нь α/β архитектурын нэг бөмбөрцөг домэйнийг агуулдаг. Дэд хэсэг бүр нь бөмбөрцөг домэйноос гарч, холбогдох үед ДНХ-ийг тойрон ороосон гогцоо агуулдаг. Энэ ферментийг ердийн тайрах дарааллаар cocrystalized болно. Цаашилбал, EcoRI хязгаарлах ферментийг клончлох, ДНХ-ийн скрининг хийх, in vitro нөхцөлд ДНХ-ийн устгах хэсгүүд зэрэг олон төрлийн молекул генетикийн техникүүдэд ашигладаг.
HindIII хязгаарлах фермент гэж юу вэ?
HindIII нь Haemophilus influenza-ийн төрөл зүйлээс тусгаарлагдсан II хэлбэрийн хязгаарлалтын фермент юм. Энэ нь гидролизийн замаар Mg2+ кофакторын дэргэд AACCTT палиндром ДНХ-ийн дарааллыг задалдаг. AA'S (5'A↓ACCTT3' ба 3'TTCGA↓A5') хоорондох энэхүү тодорхой дарааллын хуваагдал нь ДНХ-ийн молекул дээр наалдамхай төгсгөл гэж нэрлэгддэг 5' хэт уналт үүсгэдэг. Энэ фермент нь бактери гэх мэт прокариот организмд байдаг. Бактери энэ ферментийг бактериофаг зэрэг вирусын эсрэг хамгаалалтын механизм болгон ашигладаг.
Зураг 02: HindIII
Бүтцийн хувьд HindIII нь гомодимер юм. Энэ нь бусад төрлийн II хязгаарлалтын ферментүүдийн нэгэн адил дөрвөн β хуудас ба нэг α спиральаас бүрдэх нийтлэг бүтцийн цөмийг агуулдаг. Энэ ферментийн молекул масс нь 34.9 кДа байна. Цаашилбал, HindIII нь ДНХ-ийн дараалал, зураглал гэх мэт орчин үеийн молекул биологийн шинжлэх ухааны туршилтуудад маш хэрэгтэй.
EcoRI болон HindIII хязгаарлах ферментүүдийн хооронд ямар төстэй зүйл байдаг вэ?
- EcoRI болон HindIII нь II төрлийн хязгаарлалтын ферментийн бүлэгт хамаарах хоёр хязгаарлах фермент юм.
- EcoRI болон HindIII нь 1970-аад оны эхээр олдсон.
- EcoRI болон HindIII хоёулаа PD.. D/EXK амин хүчлийн дарааллын сэдлийг агуулдаг.
- Хязгаарлалтын ферментүүд хоёулаа ДНХ-ийн маш өвөрмөц задралыг гүйцэтгэдэг.
- Эдгээр хязгаарлах ферментүүд нь Mg2+-ийг тусгай үйл ажиллагаандаа кофактор болгон шаарддаг.
- ДНХ-г огтолсны дараа тэдгээр нь наалдамхай үзүүр үүсгэдэг.
- Эдгээр нь орчин үеийн молекул биологийн судалгаанд маш хэрэгтэй бүрэлдэхүүн хэсэг юм.
EcoRI болон HindIII хязгаарлах ферментүүдийн хооронд ямар ялгаа байдаг вэ?
EcoRI нь E.coli-ийн зүйлээс тусгаарлагдсан II хэлбэрийн хязгаарлалтын фермент бол HindIII нь Haemophilus influenza-ийн зүйлээс тусгаарлагдсан II хэлбэрийн хязгаарлалтын фермент юм. Тиймээс энэ нь EcoRI болон HindIII хоёрын гол ялгаа юм. Цаашилбал, EcoRI нь ДНХ-г G↓AATTC таних дарааллаар тасладаг бол HindIII нь ДНХ-г A↓ACCTT тодорхой таних дарааллаар тасалдаг.
Доорх инфографик нь EcoRI болон HindIII-ийн ялгааг хүснэгт хэлбэрээр үзүүлж, зэрэгцүүлэн харьцуулж байна.
Хураангуй – EcoRI ба HindIII хязгаарлалтын ферментүүд
EcoRI ба HindIII нь II төрлийн p дэд ангилалд хамаарах хязгаарлалтын хоёр фермент юм. Тэд ДНХ-ийн маш тодорхой задралыг гүйцэтгэдэг. EcoRI нь E.coli-ийн зүйлээс тусгаарлагдсан II хэлбэрийн хязгаарлалтын фермент бол HindIII нь Haemophilus influenza-ийн зүйлээс тусгаарлагдсан II хэлбэрийн хязгаарлалтын фермент юм. Энэ нь EcoRI болон HindIII хоёрын ялгааг нэгтгэн харуулав.
