Полисомын профайлчлал ба рибосомын профайлчлалын гол ялгаа нь полисомын профайлыг орчуулах явцад рибосом ба мРНХ (полисом) хоёуланг нь ашиглан рибосомын төлөв байдалд дүн шинжилгээ хийдэг бол рибосомын профайл нь орчуулгын явцад зөвхөн мРНХ-ийн дарааллыг ашиглан рибосомын төлөв байдалд дүн шинжилгээ хийдэгт оршино.
Орчуулга нь mRNA дахь мэдээллийг амин хүчлийн дараалал болгон хувиргадаг уургийн нийлэгжилтийн хоёр дахь үе шат юм. Translatomics нь организмын эсэд идэвхтэй орчуулагддаг ORF (нээлттэй унших хүрээ)-ийн судалгаа юм. Полизом ба рибосомын профайлыг тодорхойлох арга нь молекулын биологийн салбарт транслатомыг шинжлэх хүрээнд өөр өөр параметрүүдийг үнэлэх, дүгнэлт гаргах хоёр төрлийн арга юм.
Полизомын профиль гэж юу вэ?
Полисомын профайл нь рибосом болон мРНХ (полисом) хоёрын зан төлөвт дүн шинжилгээ хийх замаар тодорхой мРНХ-ийн орчуулгын төлөвийг гаргах арга юм. Өөрөөр хэлбэл, энэ техник нь мРНХ-ийн рибосомтой холбоотой талаарх мэдээлэл, дүгнэлтийг өгдөг. Полисом гэдэг нь орчуулгын суналтын үе шатанд байгаа мРНХ-тэй холбогдсон рибосомын бүлгийг хэлнэ.
Зураг 01: Полизомын профайл
Полизомын профайл гаргахад эсийн лизат шаардлагатай бөгөөд дараа нь центрифуг хийнэ. Дараа нь центрифугжүүлсэн дээжийг нягтралд нь үндэслэн рибосомын жижиг, том дэд нэгжүүд болон полисом үүсэхэд оролцдог харгалзах мРНХ-ийг тодорхойлохын тулд ялгадаг. Цаашилбал, процесс нь оптик нягтыг хэмжихэд хамаарна. Мэргэжилтнүүд полисомын профайл хийх шаардлагатай.
Полисомын профайл хийх техник нь олон хэрэглээний чухал хэрэгсэл юм. Эрдэмтэд эс дэх орчуулгын түвшинг судлахын тулд энэ аргыг ашигладаг. Тодруулбал, энэ нь бие даасан уураг, тэдгээрийн өвөрмөц мРНХ-ийн судалгаанд үнэн зөв мэдээлэл өгөх хэрэгсэл юм. Тодорхой мРНХ-ийн орчуулгын түвшинг судлахын тулд полисомын профайлыг тодорхойлох арга нь амин чухал юм. Энд мРНХ-ийн 3' ба 5' дарааллыг тэдгээрийн үүсгэсэн мРНХ-ийн хэмжээ болон орчуулгын түвшинд үзүүлэх нөлөөг харгалзан судалж болно.
Рибосомын профайл гэж юу вэ?
Рибосомын профайл нь орчуулгын явцад рибосомын мРНХ-тэй нь хамааруулан түүний зан төлөвийг шинжлэх арга юм. Энэ аргыг Жоан Стейц, Мэрилин Козак нар олж, хөгжүүлсэн. Хожим нь энэ технологийг Николас, Жонатан хэмээх хоёр эрдэмтэн дараагийн үеийн дараалалтай хослуулан хөгжүүлсэн бөгөөд энэ нь рибосомын ойр дотно байдлыг цэвэршүүлэх (TRAP) аргачлал гэх мэт өөр өөр холбогдох техникүүдийг хөгжүүлэхэд хүргэсэн.
Зураг 02: Рибосомын дараалал
Рибосомын профайлыг тодорхойлох процедур нь мРНХ-г тусгаарлах, рибосомтой холбогддоггүй РНХ-ийг арилгах, рибосомтой холбогдсон мРНХ-ийг салгах явдал юм. Энэ процедурын дараа мРНХ-ийн тусгаарлалтыг урвуу хуулбарлаж, cDNA-ийн синтез явагдана. Эцэст нь, рибосомын зан үйлийн шинж чанарыг мРНХ-тэй харьцуулахын тулд дарааллын өгөгдлийг орчуулгын профайлтай уялдуулж болно.
Рибосомын профайл нь олон судлаачдад орчуулгын эхлэлийн байршлын байршил, эс эсвэл эдэд орчуулагдсан нээлттэй унших хүрээ (ORFs), мРНХ дээрх рибосомын тархалт, хурдыг тодорхойлоход тусалдаг. рибосомыг орчуулах. Рибосомын профайлыг мөн рибосомын ул мөр эсвэл Рибо дараалал гэж нэрлэдэг.
Полисомын профиль болон рибосомын профайлчлалын хооронд ямар төстэй зүйл байдаг вэ?
- Полисом ба рибосомын профайлыг тогтоох нь судалгаанд чухал ач холбогдолтой молекул биологийн арга юм.
- Тэд орчуулгын үйл явцын талаар мэдээлэл өгдөг.
- Профайл үүсгэх хоёр процесс нь орчуулгын шинжилгээгээр өгөгдөл өгдөг.
- Нарийвчлалтай үр дүнд хүрэхийн тулд хоёр аргыг хоёуланг нь гүйцэтгэхэд мэргэжлийн мэргэжилтнүүд шаардлагатай.
- Биомэдээлэл зүйн хэрэгслүүд нь хоёуланд нь чухал үүрэг гүйцэтгэдэг.
Полизомын профайл ба рибосомын профайлчлалын хооронд ямар ялгаа байдаг вэ?
Полисомын профайл нь орчуулгын явцад рибосом болон мРНХ (полисом) хоёуланг нь ашиглан рибосомын төлөв байдалд дүн шинжилгээ хийдэг бол рибосомын профайл нь орчуулгын явцад зөвхөн мРНХ-ийн дарааллыг ашиглан рибосомын төлөв байдалд дүн шинжилгээ хийдэг. Тиймээс энэ нь полисомын профайл ба рибосомын профайлчлалын гол ялгаа юм. Нэмж дурдахад, полисомын профайл нь нягтралын градиент центрифуг, оптик нягтын хэмжилт зэрэг аргуудыг агуулдаг бол рибосомын профайл нь мРНХ олборлох, дараалал тогтоох аргуудыг агуулдаг. Мөн рибосомын профайл нь полисомын профайлаас илүү нарийвчлалтай.
Доорх инфографик нь полисом болон рибосомын профайлын ялгааг зэрэгцүүлэн харьцуулах зорилгоор хүснэгт хэлбэрээр үзүүлэв.
Товч мэдээлэл – Полизомын профайл ба рибосомын профиль
Орчуулга нь мРНХ-ийн дарааллын талаарх мэдээллийг амин хүчлийн дараалал болгон хувиргах уургийн нийлэгжилтийн хоёр дахь үе шат юм. Энэ процесс нь мРНХ загвар, рибосом, амин хүчил, тРНХ болон бусад хүчин зүйлсийг шаарддаг. Полизом ба рибосомын профайл нь хоёр молекулын арга юм. Полисомын профайл нь орчуулгын явцад рибосом болон мРНХ (полисом)-ийг хоёуланг нь ашиглан рибосомын төлөв байдалд дүн шинжилгээ хийдэг бол рибосомын профайл нь орчуулгын явцад зөвхөн мРНХ-ийн дарааллыг ашиглан рибосомын төлөв байдалд дүн шинжилгээ хийдэг. Полисомын профайл нь нягтралын градиент центрифуг, оптик нягтын хэмжилт зэрэг аргуудыг агуулдаг. Рибосомын профайл нь мРНХ олборлолт, cDNA синтез, дараалал зэрэг аргуудыг агуулдаг. Тиймээс энэ нь полисомын профайл ба рибосомын профайлчлалын ялгааг нэгтгэн харуулав.
