Үндсэн ялгаа – Альфа Helix ба Бета атираатай хуудас
Альфа мушгиа ба бета атираатай хуудас нь полипептидийн гинжин хэлхээний хамгийн түгээмэл хоёрдогч бүтэц юм. Эдгээр хоёр бүтцийн бүрэлдэхүүн хэсэг нь полипептидийн гинжийг нугалах үйл явцын эхний үндсэн үе шатууд юм. Alpha Helix болон Beta Pleated Sheet хоёрын гол ялгаа нь тэдгээрийн бүтцэд байдаг; Тэд тодорхой ажил хийх хоёр өөр хэлбэртэй байдаг.
Альфа Helix гэж юу вэ?
Альфа спираль нь полипептидийн гинжин хэлхээний амин хүчлийн үлдэгдлүүдийн баруун гар талын ороомог юм. Амин хүчлийн үлдэгдлийн хүрээ 4-40 үлдэгдэл хооронд хэлбэлзэж болно. Дээд ороомог дээрх C=O бүлгийн хүчилтөрөгч ба доод ороомгийн N-H бүлгийн устөрөгчийн хооронд үүссэн устөрөгчийн холбоо нь ороомгийг хамтад нь барихад тусалдаг. Гинжин дэх дөрвөн амин хүчлийн үлдэгдэл тутамд устөрөгчийн холбоо нь дээрх аргаар үүсдэг. Энэхүү жигд загвар нь ороомгийн зузаан гэх мэт тодорхой шинж чанаруудыг өгдөг бөгөөд энэ нь мушгиа тэнхлэгийн дагуу бүрэн эргэлт бүрийн уртыг зааж өгдөг. Альфа мушгиа бүтцийн тогтвортой байдал нь хэд хэдэн хүчин зүйлээс хамаарна.
Улаан өнгийн O атом, цэнхэр өнгийн N атом, ногоон тасархай шугамаар устөрөгчийн холбоо
Бета атираатай хуудас гэж юу вэ?
Бета атираатай хуудас нь бета хуудас гэгддэг бөгөөд уураг дахь хоёрдогч бүтцийн хоёр дахь хэлбэр гэж тооцогддог. Энэ нь хамгийн багадаа хоёр буюу гурван нурууны устөрөгчийн холбоогоор хажуу тийш холбогдсон бета судлуудыг агуулж, зурган дээр үзүүлсэн шиг мушгирсан, атираатай хуудас үүсгэдэг. Бета хэлхээ нь полипептидийн гинжин хэлхээний суналт юм; урт нь ерөнхийдөө 3-аас 10 амин хүчлүүдтэй тэнцүү байдаг ба түүний дотор нурууг өргөтгөсөн баталгаажуулалтад
Ферментийн каталазын болор бүтцээс авсан 4 судалтай антипараллель β хуудасны фрагмент.
a) зэргэлдээ туузан дээрх пептидийн NH ба CO-ийн бүлгүүдийн хоорондох антипараллель устөрөгчийн холбоог (цэгтэй) харуулж байна. Сумнууд гинжин хэлхээний чиглэлийг зааж, электрон нягтын контурууд нь H бус атомуудыг тоймлодог. O атомууд нь улаан бөмбөлөг, N атомууд цэнхэр, H атомууд нь энгийн байх үүднээс орхигдсон; Хажуугийн гинжийг зөвхөн эхний хажуугийн гинж С атомын (ногоон)-д харуулав
b) Төвийн хоёр β судлын ирмэгээс харах
Бета атираатай хуудсан дээр полипептидийн гинж нь хоорондоо зэрэгцэн оршдог. Энэ нь долгион шиг бүтэцтэй тул "pleated хуудас" гэсэн нэрийг авсан. Тэд устөрөгчийн холбоогоор холбогддог. Энэ бүтэц нь полипептидийн гинжийг сунгах замаар илүү их устөрөгчийн холбоо үүсгэх боломжийг олгодог.
Alpha Helix болон Beta Pleated Sheet хоёрын ялгаа нь юу вэ?
Альфа мушгиа ба бета атираатай хуудасны бүтэц
Альфа мушгиа:
Энэ бүтцэд полипептидийн нуруу нь спираль бүтэц шиг төсөөллийн тэнхлэгийн эргэн тойронд нягт холбогддог. Үүнийг мөн пептидийн гинжин хэлхээний геликоид бүтэц гэж нэрлэдэг.
Альфа спираль бүтэц үүсэх нь полипептидийн гинжийг спираль болгон мушгихад тохиолддог. Энэ нь гинжин хэлхээний бүх амин хүчлүүд хоорондоо устөрөгчийн холбоо (хүчилтөрөгчийн молекул ба устөрөгчийн молекул хоорондын холбоо) үүсгэх боломжийг олгодог. Устөрөгчийн холбоо нь спираль хэлбэрийг барьж, нягт ороомог үүсгэдэг. Энэхүү спираль хэлбэр нь альфа мушгиа маш бат бөх болгодог.
Устөрөгчийн холбоог шар цэгээр тэмдэглэв.
Бета атираатай хуудас:
Хоёр буюу түүнээс дээш тооны полипептидийн гинж(үүд) хоорондоо давхцаж, бие биентэйгээ устөрөгчийн бондын эгнээ үүсгэх үед дараах бүтцийг олж харж болно. Энэ нь хоёр аргаар тохиолдож болно; зэрэгцээ зохион байгуулалт ба эсрэг параллель зохицуулалт.
Бүтцийн жишээ:
Альфа мушгиа: Гар болон хөлийн хумсыг альфа мушгиа хэлбэрийн жишээ болгон авч болно.
Бета атираатай хуудас: Өдний бүтэц нь бета атираатай хуудасны бүтэцтэй төстэй.
Бүтцийн онцлог:
Альфа спираль: Альфа спираль бүтцэд мушгиа нэг эргэлтэнд 3.6 амин хүчил байдаг. Бүх пептидийн холбоо нь транс ба хавтгай хэлбэртэй байх ба пептидийн холбоо дахь N-H бүлгүүд нь ижил чиглэлд чиглэсэн бөгөөд энэ нь мушгиа тэнхлэгтэй ойролцоогоор параллель байна. Бүх пептидийн бондын C=O бүлгүүд нь эсрэг чиглэлд чиглэсэн бөгөөд тэдгээр нь мушгиа тэнхлэгтэй параллель байна. Пептидийн холбоо бүрийн C=O бүлэг нь пептидийн бондын N-H бүлэгтэй холбогдож устөрөгчийн холбоо үүсгэдэг. Бүх R- бүлгүүд мушгианаас гадагш чиглэсэн байна.
Бета атираатай хуудас: Бета атираатай хуудасны пептидийн холбоо бүр хавтгай бөгөөд транс-конформацтай. Зэргэлдээх гинжин хэлхээний C=O ба N-H бүлгийн пептидийн холбоо нь нэг хавтгайд байрладаг ба бие бие рүүгээ чиглэж, тэдгээрийн хооронд устөрөгчийн холбоо үүсгэдэг. Аль ч гинжин хэлхээний бүх R- бүлгүүд хуудасны хавтгайн дээр болон доор байж болно.
Тодорхойлолт:
Хоёрдогч бүтэц: Энэ нь нурууны амид ба карбонилийн бүлгүүдийн хооронд устөрөгчийн холбоо үүссэний улмаас эвхэгддэг уургийн хэлбэр юм.
