Үндсэн ялгаа – Бактерийн транспозаз ба ретровирусын интеграц
Зөөврийн удамшлын материал нь нэг бүсээс геномын доторх болон хоорондын дараагийн бүс рүү шилжих хоёр үндсэн стратегийн дагуу хөгжсөн. Нэг арга нь ДНХ молекул үүсэхээс өмнө РНХ молекулаар дамжин нүүлгэн шилжүүлэх, нөгөө зам нь ДНХ-ийн завсрын бодисыг хамардаг. Транспозаз ба вирусын интеграцууд нь ийм транспозиц удамшлын материалын жишээ юм. Бактерийн транспозазууд нь транспозонуудын төгсгөлд холбогдож, янз бүрийн механизмаар дамжуулан геномын өөр хэсэг рүү транспозоны хөдөлгөөний катализыг хөнгөвчилдөг. Ретровирусын интегразууд нь ХДХВ зэрэг ретровирусын удамшлын материалыг халдварлаж буй эзэн эсийн генетикийн материалд (ДНХ) нэгтгэхэд тусалдаг ферментүүд юм. Энэ бол нянгийн транспоза ба ретровирусын интеграцийн гол ялгаа юм.
Бактерийн транспозаз гэж юу вэ?
Транспозазыг янз бүрийн механизмаар дамжуулан геномын өөр хэсэг рүү шилжүүлэх транспозон хөдөлгөөний катализыг хөнгөвчлөх транспозонуудын төгсгөлд холбогдсон фермент гэж тодорхойлж болно. Ийм механизмд "тайрах ба буулгах механизм" ба "хуулбарлах механизм" орно. Transposase нь анх Tn3 транспозоныг шилжүүлэхэд шаардлагатай ферментийг клончлох замаар нэвтрүүлсэн. Геномын хооронд эсвэл нэг сайтаас нөгөөд шилжихэд шилжүүлж болох генетикийн элементүүд хоёр чухал стратегийг ашигласан. ДНХ-ийн хуулбарыг нийлэгжүүлэхээс өмнө РНХ-ийн завсрын бүтээгдэхүүнээр дамжуулан тээвэрлэх нь нэг стратеги бөгөөд нөгөө нь зөвхөн ДНХ-ийн завсрын бүтээгдэхүүнтэй холбогддог. Хоёр элементийг нэгтгэхэд оролцдог рекомбинацийн урвалууд нь тухайн элементийн тусгай ферментүүдийн ачаар явагддаг. Иймд ДНХ-ийн элементүүдийн хувьд эдгээр ферментийг транспозаз гэж нэрлэдэг бол РНХ-ийн элементүүдийг интеграс гэж нэрлэдэг.
Шилжүүлэн суулгах хоёр стратегийн ялгааг харьцуулж үзэхэд оруулах үйл явц нь химийн хувьд ижил юм шиг харагдаж байна. Гэвч сүүлийн үеийн нотлох баримтууд нь интеграцийн механизмын тодорхой ижил төстэй байдал нь идэвхтэй талбайг бүрдүүлдэг амин хүчлийн дарааллын бүс нутагт ажиглагдаж байгааг харуулж байна; DDE сэдэл. Одоогийн байдлаар транспозазын таван гэр бүлийг ангилж байгаа боловч шинэ транспозазын тэмдэгтүүдээр гэр бүлийн тоо нэмэгдэхгүй байна. Энэ бүлгүүдэд DDE транспозаза, Тирозин (Y) транспозаза, Серин (S) транспозаза, эргэлдэж буй тойрог транспоаза, Урвуу транскриптаза/эндонуклеаз (RT/En) гэх мэт. Эдгээр гэр бүлд ДНХ-ийг задлах, дахин нэгтгэх өвөрмөц каталитик механизмыг ашигладаг. DDE транспозаз нь анхны транспозоныг зүсэх, буулгах механизмд оролцдог бөгөөд хадгалагдсан амин хүчлүүдийн гурван багцыг агуулдаг; аспартат (D), аспартат (D) ба глутамат (E). Тирозин транспозазууд нь тирозины үлдэгдлийг ашиглан зүсэх, наах механизмд оролцдог бөгөөд энэ нь тухайн газар нутгийн онцлогтой.
Зураг 01: Бактерийн транспозаз
Серин транспозазууд нь дугуй хэлбэртэй ДНХ-ийн завсрын бодисыг агуулдаг бөгөөд дээрх гэр бүлийн нэгэн адил зүсэх, буулгах механизмыг гүйцэтгэдэг. Өнхрөх тойрог транспозаза нь хуулбарлах механизмд оролцдог бөгөөд нэг хэлхээ нь ДНХ-ийн хуулбарлах замаар зорилтот хэсэгт шууд хуулдаг. Энэ нь загвар хэлхээ болон хуулбарласан хэлхээ нь шинээр нийлэгжсэн хэлхээтэй байхыг баталгаажуулдаг. Урвуу транскриптаз/эндонуклеазын транспозаз нь шилжүүлэн суулгах янз бүрийн механизмтай.
Ретровирусын интеграл гэж юу вэ?
Retroviral Integrase-ийн хүрээнд энэ нь ХДХВ зэрэг ретровирусын генетик материалыг халдвар авсан эсийн генетик материалд (ДНХ) нэгтгэхэд тусалдаг ретровирусын фермент гэж үздэг. Эдгээр ретровирусын интеграцууд нь ихэвчлэн фагийн интегратуудтай андуурдаг. Фагийн интегразын жишээ бол λ фагийн интеграз юм. Гэхдээ эдгээр нь огт өөр ферментүүд бөгөөд андуурч болохгүй. Ретровирусын интеграцийн өмнөх цогцолборыг бүрдүүлэхэд ретровирусын интеграза чухал үүрэг гүйцэтгэдэг. Ретровирусын интегразын уураг нь ихэвчлэн гурван (03) каноник домайнаас бүрддэг. Эдгээр домайнууд уян холбоосоор холбогдсон байна.
Гурван домэйнд цайр холбогч N төгсгөлийн домэйн багтдаг бөгөөд үүнд гурван мушгиа боодол хоорондоо холбогдож, Zn2+ катион, RNase H атираатны оролцоотойгоор зохицуулж тогтворждог. каталитик гол домэйн ба С терминал ДНХ-г холбох домэйн нь SH3 нугалаа юм. Судалгаагаар, биохимийн болон бүтцийн мэдээллээр ретровирусын интеграз нь бүдэгрүүлэгчийн димер (тетрамер) болж ажиллах чадвартай болохыг харуулж байна. Мультимеризаци ба вирусын ДНХ-ийн холболтын хүрээнд ретровирусын интегразын уургийн бүх гурван домэйн. Ретровирусын интегразын гол үүрэг бол генетикийн материалыг ДНХ-д оруулах явдал юм. Энэ алхам нь ХДХВ-ийн вирусын репликацийн хамгийн чухал алхам юм. Амжилттай нэгтгэсний дараа энэ нь үлдсэн амьдралынхаа туршид эсийн хромосомын ДНХ-д байх болно.
Зураг 02: Ретровирусын интеграци
Тиймээс нэгэнт нэгтгэсэн тохиолдолд нүдийг буцаах боломжгүй болно. Эдгээр ретровирусын интеграцууд нь 3' төгсгөлийн боловсруулалт ба ковалент ligation зэрэг хоёр үндсэн урвалын катализаторд оролцдог.3' төгсгөлийн боловсруулалтын явцад вирусын ДНХ-ийн 3' төгсгөлийн CA динуклеотидыг илрүүлэх зорилгоор вирусын ДНХ-ийн 3' төгсгөлөөс 2-3 нуклеотидыг зайлуулж, ковалент холбоосын үед боловсруулсан 3' төгсгөлийг арилгадаг. вирусын ДНХ нь эзэн хромосомын ДНХ-д ковалент байдлаар холбогддог.
Бактерийн транспоаза ба ретровирусын интеграцийн хооронд ямар төстэй зүйл байдаг вэ?
Бактерийн транспозаз ба ретровирусын интеграс хоёулаа ижил амин хүчлийн дараалалтай
Бактерийн транспоаза ба ретровирусын интегразын ялгаа юу вэ?
Бактерийн транспозаз ба ретровирусын интеграс |
|
| Бактерийн транспозаза нь транспозонуудын төгсгөлд холбогддог фермент бөгөөд янз бүрийн механизмаар дамжуулан геномын өөр хэсэг рүү транспозоны хөдөлгөөний катализыг хөнгөвчилдөг. | Retroviral Integrases нь ретровирусын удамшлын материал болох ХДХВ-ийг халдвар авсан эсийн генетик материалд (ДНХ) нэгтгэхэд тусалдаг ретровирусын фермент гэж үздэг. |
| Холбох бүсүүд | |
| Бактерийн транспозазын хувьд өндөр өвөрмөц холбох бүсүүд шаардлагатай. | Холбоонд нуклеотидын дараалал бага эсвэл огт хэрэггүй. |
Хураангуй – Бактерийн транспозаз ба ретровирусын интеграц
Бактерийн транспоаза нь ретровирусын удамшлын материал болох ХДХВ-ийг халдвар авсан эсийн удамшлын материалд (ДНХ) нэгтгэхэд тусалдаг ретровирусын фермент гэж үздэг. Геномын хооронд эсвэл нэг сайтаас нөгөөд шилжихэд шилжүүлж болох генетикийн элементүүд хоёр чухал стратегийг ашигласан. Одоогийн байдлаар транспозазын таван гэр бүлийг ангилж байгаа боловч шинэ транспозазын тэмдэгтүүдээр гэр бүлийн тоо нэмэгдэхгүй байна. Retroviral Integrase нь ХДХВ зэрэг ретровирусын генетик материалыг халдвар авсан эсийн генетик материалд (ДНХ) нэгтгэхэд тусалдаг ретровирусын фермент гэж үздэг. Ретровирусын интегразын уураг нь ихэвчлэн гурван (03) каноник домайнаас бүрддэг. Ретровирусын интегразын гол үүрэг бол генетикийн материалыг ДНХ-д оруулах явдал юм. Энэ алхам нь ХДХВ-ийн вирусын репликацийн хамгийн чухал алхам юм. Тиймээс, нэгтгэсэн тохиолдолд эсийн хувьд өгөөж байхгүй болно. Энэ бол Бактерийн транспоаза ба ретровирусын интегразын ялгаа юм.
Бактерийн транспозаз ба ретровирусын интегразын PDF файлыг татаж авах
Та энэ нийтлэлийн PDF хувилбарыг татаж аваад офлайн зорилгоор ашиглах боломжтой. PDF хувилбарыг эндээс татаж авна уу: Бактерийн транспозаз ба ретровирусын интеграцийн ялгаа
