Кленовын фрагмент ба ДНХ полимераз 1-ийн гол ялгаа нь Кленовын фрагмент нь 5′-3′ экзонуклеазын идэвхгүй ДНХ полимераз 1-ийн томоохон хэсэг бөгөөд ДНХ полимераз нь E. coli-ийн фермент бөгөөд гурвууланг нь агуулдаг. 5′ - 3′ экзонуклеазын идэвхжил зэрэг домэйнууд.
ДНХ полимераз нь амьд организмын ДНХ-ийн хуулбарлахад оролцдог гол ферментүүдийн нэг юм. Хэмжээ, хэлбэрээс хамааран эукариот ба прокариотуудад ДНХ полимеразын ферментийн янз бүрийн хэлбэрүүд байдаг. ДНХ полимераз 1, 2, 3 нь зөвхөн прокариот организмд байдаг бөгөөд ДНХ-ийн хуулбарлахад өөр өөр үүрэг гүйцэтгэдэг. ДНХ полимераз 1 нь 5′-аас 3′ полимераз, 3′-аас 5′ экзонуклеазын идэвхжил, 5′-аас 3′ экзонуклеазын идэвхжилтэй гурван домэйнтэй. Кленовын фрагмент нь ДНХ полимераз 1-ийн протеолитик бүтээгдэхүүн юм. Энэ нь бүрэн бүтэн ДНХ полимераз 1-ийн 5-3′ полимераз ба 3′-аас 5′ экзонуклеазын үйл ажиллагаатай боловч 5′-аас 3′ экзонуклеазын идэвхгүй.
Кленовын фрагмент гэж юу вэ?
Кленовын фрагмент нь ДНХ полимераз 1-ийн томоохон хэсэг юм. ДНХ полимераз 1-ээс ялгаатай нь Кленовын фрагментэд 5′-аас 3′ хүртэлх экзонуклеазын чиглэл байхгүй тул 5′-3′ экзонуклеазын идэвхжил ажиглагддаггүй. Кленовын хэлтэрхийнүүд нь ДНХ-полимераза 1-ийг уураг задлах фермент болох субтилизин хэмээх протеазын хамт задлах замаар үүсдэг. Зарим хэрэглээнд Кленовын фрагментийн 3-5' экзонуклеазын идэвхжил нь хүсээгүй болдог. Кленовын фрагментийг кодлодог генийн мутацийг нэвтрүүлснээр үүнийг арилгах боломжтой. Зөвхөн 5-3' полимеразын идэвхжилтэй ферментийг экзо-Кленовын фрагмент гэж нэрлэдэг. Морфологийн хувьд Кленовын хэлтэрхий нь хүний баруун гартай төстэй. Энэ нь N-терминал 3′-5′ экзонуклеаза домэйн ба C-терминал полимеразын домэйн нь ойролцоогоор 30 А-аар тусгаарлагдсан.
Зураг 01: Кленовын фрагмент ба ДНХ полимераз 1
Кленовын хэлтэрхий нь молекул биологийн техникийн чухал хэрэгсэл юм. Кленовын хэлтэрхий нь олон төрлийн хэрэглээтэй. Эдгээр нь мохоо хэсгүүдийг гаргахын тулд мохоо төгсгөлийн клончлолд маш чухал юм. Кленоугийн хэлтэрхийнүүд нь 3′-ийн хэт их хэсгийг арилгах юм уу 5′-ийн хэт их хэсгийг дүүргэж, мохоо үзүүрийг үүсгэдэг. Түүнээс гадна Кленовын хэлтэрхийнүүд нь нэг хэлхээнээс хоёр хэлхээтэй ДНХ-ийг нэгтгэхэд ашиглагддаг. Цаашилбал, тэдгээрийг 5’-3′ ДНХ-ээс хамааралтай ДНХ полимеразын идэвхийг ашиглан цацраг идэвхт шошготой датчик бэлтгэхэд ашигладаг.
ДНХ Полимераз 1 гэж юу вэ?
ДНХ полимераз 1 (Пол 1) нь бактерийн ДНХ-ийн хуулбарлахад шаардлагатай прокариотуудад байдаг фермент юм. Энэ нь 1956 онд Артур Корнбергийн нээсэн ДНХ-ийн полимеразын анхны төрөл юм. Пол 1 нь E. coli-д хамгийн элбэг байдаг полимераз юм. Энэ нь полА генээр кодлогдсон бөгөөд 928 амин хүчлээс бүрддэг. Энэ нь гурван домайнаас бүрдэнэ. Гурван домайн бүгд өөр өөр функцийг гүйцэтгэдэг. Хоёр домэйн нь 5′-3′ экзонуклеазын үйл ажиллагаа ба 3′-5′ экзонуклеазын үйл ажиллагааг гүйцэтгэдэг. Пол 1-д агуулагддаг энэхүү үйл ажиллагааны улмаас энэ нь ДНХ-ийг хуулбарлах фермент гэхээсээ илүү ДНХ засдаг ферментийн хувьд алдартай. Гурав дахь домэйн нь загвар ДНХ-г гаргахаас өмнө олон полимержилтийг (5′-аас 3′) хурдасгах чадвартай бөгөөд шинэ ДНХ-г дүүргэж, РНХ праймеруудыг устгаснаар Оказаки хэлтэрхийг хооронд нь холбох чадвартай.
Зураг 02: ДНХ Полимераз
E Coli-аас тусгаарлагдсан Pol 1-ийг молекулын хэрэглээнд өргөнөөр ашигласан. Гэсэн хэдий ч Taq Polymerase-ийг олж илрүүлсний дараа ПГУ-ын технологид E Coli Pol 1-ийг орлуулсан. Так полимераз нь Пол 1-д хамаарах термостат ДНХ полимеразын нэг төрөл юм.
Кленовын фрагмент ба ДНХ-полимераз 1-ийн хооронд ямар төстэй зүйл байдаг вэ?
- Кленовын хэлтэрхий нь ДНХ-полимераза 1-ийн том хэсэг юм.
- Тэдгээр нь 5'-3′ ДНХ-ээс хамааралтай ДНХ полимеразын идэвхжил ба 3'-5′ экзонуклеазын идэвхжилтэй бөгөөд энэ нь шалгалтыг зуучилдаг.
- Тэдгээрийг олон зорилгоор ашигладаг.
Кленовын фрагмент ба ДНХ полимеразын 1-ийн ялгаа юу вэ?
Кленовын фрагмент ба ДНХ полимеразын 1-ийн гол ялгаа нь Кленовын фрагмент 5′-аас 3′ экзонуклеазын идэвхгүй байхад ДНХ полимераз 1 нь 5′-аас 3′ экзонуклеазын идэвхжилгүй байдаг. Тиймээс Кленовын фрагмент нь хоёр домайнтай бол ДНХ полимераз 1 нь бүх гурван домайнтай.
Доорх инфографик нь Кленовын фрагмент ба ДНХ полимеразын 1-ийн ялгааны дэлгэрэнгүйг харуулж байна.
Хураангуй – Кленовын фрагмент ба ДНХ полимераз 1
ДНХ полимераз 1 нь E. coli-ийн фермент бөгөөд 5′-аас 3′ полимержих домэйн, 3′-аас 5′ экзонуклеазын домэйн, 5′-аас 3′ экзонуклеазын домэйн гэсэн гурван домэйнтэй. Кленовын фрагмент нь ДНХ полимеразын томоохон хэсэг юм. Түүнд ДНХ полимераза 1-ийн нэг домэйн дутагдаж байгаа бөгөөд энэ нь 5′-3′ экзонуклеазын домэйн юм. Кленовын фрагмент ба ДНХ полимеразын 1-ийн гол ялгаа нь Кленовын фрагментүүд 5′-аас 3′ экзонуклеазын домайнгүй байхад ДНХ полимераз 1 нь 5′-аас 3′ экзонуклеазын домайнтай байдаг.