LTR болон LTR бус ретротранспозонуудын гол ялгаа нь LTR ретротранспозонууд нь бүтэцдээ урт төгсгөлийн давталттай ретротранспозонуудын нэг төрөл байдаг бол LTR бус ретротранспозонууд нь төгсгөлийн урт давталтгүй ретротранспозонуудын нэг төрөл юм. тэдгээрийн бүтцэд.
Ретротранспозонууд (I ангиллын шилжүүлэн суулгах элементүүд эсвэл РНХ-ийн завсрын бодисоор дамждаг транспозонууд) нь геномын өөр өөр байршилд хуулж, буулгах чадвартай генетикийн бүрэлдэхүүн хэсэг юм. Тэд үүнийг РНХ шилжүүлэн суулгах завсрын бодисыг ашиглан урвуу транскрипц гэж нэрлэгддэг процессоор дамжуулан РНХ-ийг дахин ДНХ болгон хувиргах замаар гүйцэтгэдэг. LTR болон LTR бус ретротранспозон гэсэн хоёр үндсэн төрөл байдаг
LTR ретротранспозон гэж юу вэ?
LTR ретротранспозон нь бүтэцдээ урт төгсгөлийн давталттай ретротранспозонуудын нэг төрөл юм. LTR ретротранспозоны төгсгөл бүрт давтагдах ДНХ-ийн урт хэлхээг олж болно. Эдгээрийг урт терминалын давталт (LTR) гэж нэрлэдэг. LTR бүр нь хэдэн зуун үндсэн хос урттай. LTR ретротранспозон нь ихэвчлэн 5 килобазаас илүү урттай байдаг. Түүгээр ч зогсохгүй урт төгсгөлийн давталтын хооронд ретровирусын генүүд gag болон pol гентэй дүйцэхүйц хуулбарлах боломжтой генүүд байдаг. Эдгээр генүүд нь давхцаж байгаа тул үүссэн транскриптийг функциональ генийн бүтээгдэхүүн болгон боловсруулдаг протеазыг кодчилдог.
Зураг 01: LTR ретротранспозон
Ретротранспозонуудын гаг ген нь бусад ретротранспозонуудын транскрипттэй нийлж вирус төст бөөмс үүсгэдэг бүтээгдэхүүнийг үүсгэдэг. Пол ген нь урвуу транскриптаза, интеграз, рибонуклеаз H домэйн зэрэг фермент агуулсан бүтээгдэхүүнийг үйлдвэрлэдэг. Урвуу транскриптаза фермент нь ретротранспозон ДНХ-ийн урвуу транскрипцийг гүйцэтгэдэг. Интеграза фермент нь ретротранспозон ДНХ-ийг эукариот геномын ДНХ-д нэгтгэдэг. Рибонуклеаза H домэйнууд нь РНХ-ийн завсрын хоорондын фосфодиэстерийн холбоог таслахад тустай. LTR ретротранспозонууд нь транскриптийг tRNA-тай холбох газруудтай кодчилдог бөгөөд ингэснээр тэд урвуу транскрипцийг хялбархан хийж чаддаг. Цаашилбал, ретротранспозон нь эукариот геномын мэдээллийг агуулдаг тул эукариот эсийн бусад геномын байршилд өөрийн хуулбарыг оруулж чаддаг.
LTR бус ретротранспозон гэж юу вэ?
LTR бус ретротранспозонууд нь бүтэцдээ урт төгсгөлийн давталт байдаггүй ретротранспозонуудын нэг төрөл юм. LTR ретротранспозонуудын нэгэн адил LTR бус ретротранспозонууд нь урвуу транскриптаза, РНХ холбогч уураг, нуклеаз, заримдаа рибонуклеаз H домэйны генийг агуулдаг. Гэхдээ тэдгээрт урт терминалын давталт дутагдаж байна; Үүний оронд тэдгээр нь бие биенийхээ хажууд урвуу дараалалтай байх боломжтой богино давталтуудтай. РНХ холбогч уургууд нь РНХ транспозиция завсрын бүтээгдэхүүнтэй холбогддог ба нуклеазууд нь нуклейн хүчлүүдийн нуклеотидын хоорондох фосфодиэстерийн холбоог тасалдаг.
Зураг 02: LTR ба LTR бус ретротранспозон
Хэдийгээр тэдгээр нь ретротранспозон боловч LTR ретротранспозонтой адил РНХ-ийн завсрын бүтээгдэхүүнийг ашиглан урвуу транскрипцийг хийж чадахгүй. Учир нь LTR бус ретротранспозонууд нь тРНХ-г холбодог дарааллыг агуулдаггүй. Тиймээс mRNA-д хөрвүүлж, уураг руу хөрвүүлсэн LTR бус ретротранспозон нь урвуу транскриптазын үүрэг гүйцэтгэдэг. Урвуу транскриптаза нь LTR бус ретротранспозон РНХ-ийн ДНХ-ийн хуулбарыг хийдэг бөгөөд энэ нь шинэ сайт дээр геномд нэгтгэгдэх боломжтой. Цаашилбал, LTR бус ретротранспозонууд нь хоёр төрөлд хуваагдана: LINEs (урт огтлолцсон цөмийн элементүүд) ба SINEs (богино огтлолцсон цөмийн элементүүд).
LTR болон LTR бус ретротранспозонуудын хооронд ямар төстэй зүйл байдаг вэ?
- LTR болон LTR бус ретротранспозонууд нь ретротранспозонуудын үндсэн хоёр төрөл юм.
- Хоёр төрөл нь урвуу транскриптаза, РНХ холбогч уураг, нуклеаз, рибонуклеаз H домэйн зэрэг ферментийн генийг агуулдаг.
- Тэдгээрийг хүний геномоос олж болно.
- Хоёр төрөл хоёулаа хувьслын хувьд чухал.
LTR болон LTR бус ретротранспозонуудын хооронд ямар ялгаа байдаг вэ?
LTR ретротранспозонууд бүтцээрээ урт төгсгөлийн давталттай байдаг бол LTR бус ретротранспозонууд бүтцээрээ урт төгсгөлийн давталтгүй байдаг. Тиймээс энэ нь LTR болон LTR бус ретротранспозонуудын гол ялгаа юм. Цаашилбал, LTR ретротранспозонууд нь удаан хугацааны шууд давталттай байдаг бөгөөд энэ нь зөвхөн нэг дараалал нь өөрсдийгөө давтдаг. Нөгөөтэйгүүр, LTR бус ретротранспозонууд нь бие биенийхээ хажууд урвуу дараалалтай байх боломжтой богино давталттай байдаг.
Доорх инфографик нь LTR болон LTR бус ретротранспозонуудын ялгааг зэрэгцүүлэн харьцуулахын тулд хүснэгт хэлбэрээр үзүүлэв.
Товч мэдээлэл – LTR ба LTR бус ретротранспозонууд
LTR болон LTR бус ретротранспозонууд нь ретротранспозонуудын үндсэн хоёр төрөл юм. LTR ретротранспозонууд бүтцээрээ урт төгсгөлийн давталттай байдаг бол LTR бус ретротранспозонууд бүтцээрээ урт төгсгөлийн давталттай байдаггүй. Энэ бол LTR болон LTR бус ретротранспозонуудын гол ялгаа юм.
