Ксилен цианол ба бромофенол хөх хоёрын гол ялгаа нь 1% агароз гель дэх ксилол цианол нь удаан, харин бромофенолын хөх илүү хурдан шилждэгт оршино.
Ксилен цианол ба бромофенол цэнхэр нь агароз гель электрофорез болон полиакриламид гель электрофорезийн үйл явцыг хянахад ашиглаж болох өнгөт тэмдэглэгээний хувьд чухал юм.
Ксилен цианол гэж юу вэ?
Ксилен цианол нь электрофорезийн өнгөт тэмдэглэгээ буюу зам мөрний будаг юм. Энэ нь агароз гель электрофорез ба полиакриламид гель электрофорезийн үйл явцыг хянахад тустай. Энэ бодисыг дээжтэй холих үед энэ бодисын концентраци ихэвчлэн 0 орчим байдаг.005% -аас 0.03% хүртэл. Бидний ксилен цианолыг ашиглаж болох зарим ижил утгатай үгэнд Хүчил Цэнхэр 147, ксилен цианол, ксилен цианол FF, ксилен цианол FF гэх мэт орно.
Энэ нэгдлийн химийн томъёо нь C25H27N2NaO 6S2 Ксилен цианолын молийн масс 538.61 г/моль. Энэ бодис нь 1% агароз гель дэх 4-5 килобаза хос ДНХ-ийн фрагментийн хурдтайгаар шилжиж чаддаг. Гэхдээ энэ нь бидний ашигладаг буферээс хамаарна. Ихэвчлэн 6% полиакриламидын гель дээрх ксилен цианол нь 140 орчим суурь хос ДНХ-ийн фрагментийн хурдтайгаар шилжиж чаддаг. Нөгөөтэйгүүр, энэ нь 25 суурийн олигонуклеотидын хурдаар 20% денатурат полиакриламидын гель электрофорезид шилжиж чаддаг.
Ксилен цианолын устөрөгчийн бондын донорын тоо 2м, устөрөгчийн бондын хүлээн авагчийн тоо 8. Энэ нэгдлийн эргэдэг бондын тоог 7 гэж өгч болно. Ксилен цианолын нарийн төвөгтэй байдлыг 1120 градус гэж тодорхойлж болно. Энэ нь 1-ийн тодорхойлсон бондын стерео төвийн тоотой.
Бромфенолын цэнхэр гэж юу вэ?
Бромофенол цэнхэр нь рН-ийн ашигтай үзүүлэлт бөгөөд электрофорезийн өнгөт тэмдэглэгээ болон будагч бодис болгон ашиглахад тохиромжтой. Энэ нь 3', 3", 5', 5" тетрабромфенолсульфонфталеин, BPB гэсэн химийн нэртэй. Энэ нэгдлийн химийн томъёо нь C19H10Br4O5 S. Энэ нэгдлийн молийн масс нь 669.96 г / моль юм. Энэ нь үнэргүй бөгөөд түүний нягтыг 2.2 г/мл гэж хэлж болно. Түүний хайлах цэг нь Цельсийн 273 хэм, буцлах цэг нь Цельсийн 279 хэм юм. Бид мөстлөгийн цууны хүчил дэх фенолсульфонфталеины халуун уусмалд илүүдэл бромыг аажмаар нэмж бэлдэж болно.
Бромфенолын хөх нь рН 3.0-аас 4.6 хүртэлх хүчил-суурь үзүүлэлтийн хувьд ашигтай байдаг. Энэ нь рН 3.0-аас рН 4.6 хүртэл шар өнгөтэй болж өөрчлөгдөх чадвартай. Түүнээс гадна энэ нь буцах боломжтой урвал юм. Бүтцийн хувьд бромофенол хөх нь фенолфталеинтай төстэй.
Түүнээс гадна бид үүнийг агароз гель электрофорез болон полиакриламид гель электрофорезын үйл явцыг хянахын тулд өнгөт тэмдэглэгээ болгон ашиглаж болно. Энэ бодис нь дунд зэргийн рН-д сөрөг цэнэг зөөвөрлөх чадвартай бөгөөд энэ нь гель дэх ДНХ эсвэл уурагтай ижил чиглэлд шилжиж чаддаг. Шилжилтийн хурд нь гельний нягтрал болон буферийн найрлагаас хамаарч өөр өөр байж болно. Гэхдээ нэг удаагийн TAE буфер эсвэл TBE буферт агуулагдах ердийн 1% агароз гель дотор энэ бодис нь 300 орчим суурь хосын ДНХ-ийн фрагменттэй ижил хурдаар шилждэг.
Ксилен цианол ба бромофенолын цэнхэр хоёрын ялгаа юу вэ?
Цилен цианол ба бромофенол цэнхэр өнгөний чухал тэмдэглэгээ юм. Ксилен цианол ба бромофенол цэнхэр хоёрын гол ялгаа нь 1% агароз гель дэх ксилол цианол нь удаан, харин бромофенолын хөх илүү хурдан шилждэгт оршино.
Хүснэгт хэлбэрээр ксилен цианол болон бромофенолын хөх хоёрын ялгааг тоймлон харуулав.
Хураангуй – Ксилен цианол ба Бромфенолын цэнхэр
Ксилен цианол ба бромофенол цэнхэр нь агароз гель электрофорез ба полиакриламид гель электрофорезийн үйл явцыг хянахад хэрэглэгддэг өнгөт тэмдэглэгээний хувьд чухал юм. Ксилен цианол ба бромофенол хөх хоёрын гол ялгаа нь 1% агароз гель дэх ксилол цианол нь удаан, харин бромофенолын хөх илүү хурдан шилждэгт оршино.
