Үндсэн ялгаа – Протеомик ба Транскриптомик
Омик технологи нь организмын янз бүрийн биомолекулуудыг шинж чанар, үйл ажиллагааных нь хувьд цогц байдлаар авч үздэг орчин үеийн чиг хандлага юм. Омик технологи нь өргөн хүрээний хэрэглээтэй. Биологийн дээжийн өөр өөр омикууд нь геномик, протеомик, транскриптомик ба метаболомикийг агуулдаг. Протеомик нь амьд организмын бүх уургийг бүрэн судлах явдал юм. Энэ нь организм дахь бүх илэрхийлэгддэг уургийн багц, түүний бүтэц, үйл ажиллагааны шинж чанар гэж тодорхойлогддог. Тиймээс уургийн бүрэн багц нь протеомыг үүсгэдэг. Транскриптомик нь амьд организмд байдаг бүх элч РНХ (мРНХ) молекулуудын бүрэн судалгаа юм. Тиймээс транскриптомик нь амьд организмд идэвхтэй илэрхийлэгддэг генийг авч үздэг. Амьд организм дахь мРНХ-ийн нийт багцыг транскриптом гэж нэрлэдэг. Протеомик ба Транскриптомикийн гол ялгаа нь биомолекулын төрлөөс хамаарна. Протеомикийн хувьд амьд организм дахь илэрхийлэгдсэн уургийн нийт багцыг судалдаг бол транскриптомикт амьд организмын нийт мРНХ-ийг судалдаг.
Протеомик гэж юу вэ?
Протеомик гэдэг нэр томьёо нь 1995 онд бий болсон бөгөөд анх эс, эд, организмын нийт уургийн нэмэлт гэж тодорхойлсон. Протеомикийн судалгааг ахиулснаар олон судалгааны салбарыг багтаасан дээвэр нэр томъёо болгон өөрчилсөн. Одоогийн байдлаар протеомик сэдвийн хүрээнд уургийн бүтэц, чиг баримжаа, үйл ажиллагаа, түүний харилцан үйлчлэл, өөрчлөлт, хэрэглээ, ач холбогдлыг судалж байна. Тиймээс протеомикийн чиглэлээр одоогоор маш их судалгаа хийгдэж байна.
Анхны протеомик судалгааг гэдэсний савханцар дахь уургийн агууламжийг тодорхойлох зорилгоор хийсэн. Нийт уургийн агууламжийн зураглалыг хоёр хэмжээст (2D) гель ашиглан хийсэн. Үүнийг амжилттай хийсний дараа эрдэмтэд далайн гахай, хулгана зэрэг амьтдын уургийн нийт агууламжийг тодорхойлоход шилжсэн. Одоогоор хүний уургийн зураглалыг 2D гель электрофорез ашиглан хийж байна.
Протеомикийн хэрэглээ
Уургийн катализаторын шинж чанараас шалтгаалан уураг нь ихэнх үйл ажиллагааг удирддаг молекулууд байдаг тул протеомикийг судлах нь олон давуу талтай. Тиймээс бүхэл бүтэн уургийн судалгаа нь организмын эрүүл мэндийн байдлын талаархи мэдээллийг өгөх боломжтой. Зарим програмууд нь;
- Геномын тайлбар: Организмын уургийн агуулгыг судалснаар идэвхтэй уургийн нэгдлийг хариуцах геномыг яг таг тодорхойлж болно. Энэ хувилбарт бүх геномикийн үр дүн, транскриптомик болон протеомик чухал.
- Өвчний тодорхойлох / Оношлогоо: Протеомикийг эрүүл, өвчтэй хоёрыг харьцуулан өвчний нөхцөл байдлыг тодорхойлоход ашигладаг
- Туршилтын явцад судлагдсан уургийн экспрессийг хэрэгжүүлэх.
- Уургийн өөрчлөлт ба харилцан үйлчлэлийн судалгаа: Уургийг in vitro болон in vivo нөхцөлд ашиглахын тулд эдгээр гаргаж авсан уургуудын хадгалалтын нөхцлийг шийдэж, in vitro, in vivo болон in vivo уургийн үйл ажиллагааг судлах. – цахиурын аргууд.
Зураг 01: Протеомикс
Протеомикт өөр өөр техникүүд байдаг
- 2D гель электрофорез ашиглан нийт уургийг ялгаж, уураг ялгана. Өндөр хүчин чадалтай шингэн хроматографи (HPLC) ашиглан уургийг мөн ялгаж болно.
- Эдмундын дарааллын арга эсвэл Масс спектрометр зэрэг аргуудыг ашиглан гаргаж авсан уургийн дараалал.
- Дараалалыг тодорхойлсны дараа уургийн агуулгын бүтэц, функциональ шинж чанарыг компьютерт суурилсан программ хангамж болон биоинформатикийн хэрэглүүр ашиглан шинжилнэ.
Транскриптомик гэж юу вэ?
Транскриптом гэдэг нэр томъёо саяхан бий болсон. Транскриптомик нь организмын нийт мРНХ-ийн агуулгыг судалдаг шинжлэх ухаан юм. Нийт мРНХ нь амьд организм эсвэл эс дэх илэрхийлэгдсэн ДНХ юм. мРНХ-ийн бүрэн цуглуулгыг транскриптом гэж нэрлэдэг.
Транскриптомийг шинжлэх алхмууд нь,
- РНХ-г гаргаж авах, поли DT ирмэгээр багана гель хроматографи ашиглан мРНХ-г ялгах.
- МРНХ-ийн дараалал хийгдсэн.
Microarray технологи нь организмын транскриптомыг тодорхойлох нийтлэг арга юм. Microarray техник нь транскриптомын нэмэлт судал бүхий датчик хавтанг агуулдаг. Эрлийзжүүлсний дараа организм эсвэл эсэд байгаа мРНХ-ийг тодорхойлж болно.
Зураг 02: Транскриптомийн техник
Транскриптомикийг одоо анагаах ухаанд өргөнөөр ашиглаж байна. Өвчний оношлогоо, өвчний профайлыг тодорхойлох нь Транскриптомикийг ашигладаг гол салбар юм. Организмын транскриптомийг шинжилснээр гадны мРНХ-ийг тодорхойлж, хэрэв ямар нэгэн халдвар байгаа бол түүнийг тодорхойлох боломжтой. Кодлогдоогүй РНХ-ийг транскриптомийн технологи ашиглан салгаж болно. Мөн хүрээлэн буй орчны янз бүрийн стресс дор генийн илэрхийлэлийг хянах боломжтой.
Протеомик ба Транскриптомикийн хооронд ямар төстэй зүйл байдаг вэ?
- Хоёулаа омик технологийн үзэл баримтлалын нэг хэсэг.
- Хоёулаа өвчнийг оношлох, организмын өвчний шинж чанарыг тодорхойлоход ашигладаг.
- Судалгааны хоёр талбар нь биомолекулыг гаргаж авах, биомолекулыг салгах, дараалал тогтоох үе шатуудыг хамарсан.
Протеомик ба транскриптомик хоёрын ялгаа юу вэ?
Протемик ба Транскриптомик |
|
| Протеомик нь амьд организмын бүх уургийг бүрэн судалдаг. | Транскриптомик нь амьд организмд байдаг бүх элч РНХ (мРНХ) молекулуудын бүрэн судалгаа юм. |
| Судлагдсан био молекулын төрөл | |
| Уургийг протеомикийн чиглэлээр судалдаг. | мРНХ-г транскриптомийн чиглэлээр судалдаг. |
| Судалсан хүчин зүйлс | |
| Уургийн бүтэц, үйл ажиллагаа, харилцан үйлчлэл, өөрчлөлт, хэрэглээг протеомикийн чиглэлээр судалдаг. | МРНХ-ийн дарааллын бүтэц, хүрээлэн буй орчинтой харилцан үйлчлэл, хэрэглээг транскриптомийн чиглэлээр судалдаг. |
Хураангуй – Протеомик ба Транскриптомик
Омик нь амьдралын шинжлэх ухааны салбарт чухал үүрэг гүйцэтгэдэг. Протеомик гэдэг нь эс эсвэл организм дахь уургийн бүрэн цуглуулгыг бүрдүүлдэг протеомын судалгааг хэлдэг. Транскриптомик гэдэг нь мРНХ хэлбэрээр илэрхийлэгдсэн ДНХ-ийн иж бүрэн багц болох транскриптомын судалгааг хэлнэ. Протеомик ба транскриптомик гэсэн хоёр судалгааны чиглэл нь геномикийг нэвтрүүлсний дараа үүссэн бөгөөд одоогоор эмнэлгийн оношлогоо, организмын шинж чанар, скрининг хийхэд өргөн хэрэглэгддэг. Энэ бол протеомик ба транскриптомикийн ялгаа юм.
Протеомик ба Транскриптомикийн PDF файлыг татаж авах
Та энэ нийтлэлийн PDF хувилбарыг татаж аваад офлайн зорилгоор ашиглах боломжтой. PDF хувилбарыг эндээс татаж авна уу: Протеомик ба Транскриптомикийн ялгаа
