Зорилтот болон зорилтот бус протеомикийн гол ялгаа нь зорилтот протеомик нь тодорхой уургийн элбэг дэлбэг байдлыг хэмжихэд чиглэгддэг бол зорилтот бус протеомик нь тодорхой уургийг онилдоггүй явдал юм.
Протеомик нь уураг, тэдгээрийн бүтэц, үйл ажиллагааны томоохон судалгаа юм. Энэ нь тодорхой нөхцөлд эс, эд эсвэл организм дахь уургийн нэмэлтийг бүхэлд нь судалдаг. Зорилтот протеомик ба зорилтот бус протеомик гэж хоёр төрлийн протеомик байдаг.
Зорилтот протеомик гэж юу вэ?
Нэрнээс нь харахад зорилтот протеомик нь шинжилгээнд зориулж уургийн нийлмэл холимог дахь тодорхой уураг эсвэл пептидийг чиглүүлдэг. Дараа нь урьдчилан сонгосон тодорхой уураг байгаа эсэх, тоо хэмжээг шинжилдэг. Энэ аргыг зөвхөн нэг дээж эсвэл олон дээжинд ашиглах боломжтой. Энэ арга нь уургийн тодорхой бүлэгт ч тохиромжтой. Үүний үр дүнд илүү нарийвчлалтай, тоон мэдээлэл, эмзэг мэдээлэл бий болно. Түүнээс гадна масс спектрометрийг зорилтот протеомиктой хослуулан илүү нарийвчлалтай найдвартай хэмжилтүүдийг гаргадаг. Энэ аргад шинжилгээ хийхдээ гурвалсан дөрвөлсөн масс спектрометр (QQQ) ашигладаг.
Зураг 01: Протеомикс
Зорилтот протеомик нь сөнөөх зорилт үнэхээр унасан эсэхийг шалгах эсвэл цусны ийлдэс, тархины шингэн эсвэл эсийн лизат зэрэгт тодорхой уураг/пептидийн хэмжээг тодорхойлохыг хүсвэл тохиромжтой арга юм. Хэрэв та тодорхой уураг нь дээжинд ялгавартай илэрхийлэгддэг эсэхийг шалгахыг хүсвэл эсвэл цаг хугацааны туршилтын явцад үүнийг ашиглана уу.
Зорилтот бус протеомик гэж юу вэ?
Зорилтот бус протеомик нь нэрээр нь дурьдсанчлан тодорхой уураг эсвэл пептидийг шинжилдэггүй. Discovery proteomics бол Untargeted протеомикийн өөр нэр юм. Үнэн хэрэгтээ энэ нь илүү "дэлхийн" дүн шинжилгээ юм. Ерөнхийдөө зорилтот бус протеомикийг хийх нь "энэ дээж эсвэл олон дээжинд ямар уураг эсвэл уураг байдаг вэ?" Гэсэн асуултанд хариулах явдал юм. Энэ арга нь зорилтот протеомикийн хувьд эмзэг биш юм. Гэхдээ энэ нь шинэ уураг зэрэг олон уургийг тодорхойлж, хэмжиж чаддаг. Зорилтот бус протеомик нь тоон болон чанарын хэмжилтийг гаргаж чадна.
Зорилтот ба зорилтот бус протеомикийн хооронд ямар төстэй зүйл байдаг вэ?
- Зорилтот ба зорилтот бус протеомикууд дээж дэх уургийг хэмждэг.
- Тэд протеомын шинжилгээнд чухал ач холбогдолтой.
- Эдгээр аргууд нь масс спектрометрийг ашигладаг.
Зорилтот ба зорилтот бус протеомикийн ялгаа нь юу вэ?
Нэгдүгээрт, зорилтот протеомик нь уургийн нийлмэл холимог дахь тодорхой уураг эсвэл пептидийн агууламж, хэмжээг тодорхойлох явдал юм. Үүний эсрэгээр, зорилтот бус протеомик нь тодорхой уургийг онилгүйгээр дээж эсвэл дээжинд агуулагдах уургийн тоон болон чанарын судалгаа юм. Зорилтот протеомикийг урьдчилан сонгосон эсвэл зорилтот уургуудаар хийдэг бол зорилтот бус протеомикийг энэ дээж дэх уургийн төрлийг олж мэдэхийн тулд хийдэг. Түүнчлэн, зорилтот протеомик нь зорилтот бус протеомикээс илүү мэдрэмтгий байдаг.
Хураангуй – Зорилтот ба Зорилтот бус протеомикс
Дүгнэж хэлэхэд зорилтот ба зорилтот бус протеомик нь уургийн хоёр төрлийн судалгаа юм. Тэдний нэрнээс харахад зорилтот протеомик нь тодорхой уураг руу чиглэсэн байдаг бол онилсон протеомик нь тодорхой уураг руу чиглүүлдэггүй. Энэ нь зорилтот ба зорилтот бус протеомикийн ялгаа юм.
