CDS болон ORF-ийн гол ялгаа нь CDS нь уураг болж хувирдаг генийн нуклеотидын бодит дараалал, харин ORF нь орчуулгын эхлэлийн цэгээс (эхлэх кодон) эхэлж, генийн дараалалаар төгсдөг ДНХ-ийн дарааллын хэсэг юм. орчуулгыг зогсоох сайт (кодон зогсоох).
Ген нь кодлох дараалалтай (CDS). Энэ нь генийн нийт экзон ба эхлэл кодон, зогсоох кодоноос бүрдэнэ. Энэ нь уураг орчуулж, үүсгэдэг генийн жинхэнэ хэсэг юм. Нээлттэй унших хүрээ буюу ORF нь эхлэл кодон ба зогсоох кодон хооронд байрлах нуклеотидын дараалал юм. ORF дотор уураг болж хувирдаг удамшлын кодыг тасалдаг зогсоох кодон байдаггүй. Прокариотуудад генийн CDS болон ORF нь ижил байдаг.
CDS гэж юу вэ?
CDS буюу кодлох дараалал нь уураг болж хувирдаг генийн хэсэг юм. Энэ нь AUG кодон ба зогсоох кодон гэж нэрлэгддэг экзон ба хоёр кодоноос бүрдэнэ. CDS нь орчуулагдаагүй хоёр бүсийг агуулаагүй: 5’ UTR ба 3” UTR. Түүнчлэн интроныг CDS-д оруулаагүй болно.
Зураг 01: Кодлох дараалал
Хувь хүний бүх геномтой харьцуулбал кодлох дарааллыг жижиг хэсэг гэж үздэг. Кодлох дараалал нь уургийн амин хүчлийн дарааллыг бий болгоход шаардлагатай нуклеотидын дарааллаас бүрдэнэ. Тиймээс CDS нь нуклеотидын гурвалсан эсвэл кодонд хуваагдаж болох төвлөрсөн экзонууд юм. Кодонууд нь амин хүчлийг үүсгэдэг.
ORF гэж юу вэ?
Нээлттэй унших хүрээ буюу ORF нь эхлэл кодоноор эхэлж зогсох кодоноор төгсдөг нуклеотидын дарааллын тасралтгүй суналт юм. Энгийнээр хэлбэл, ORF нь эхлэх ба зогсоох кодонуудын хооронд байрлах нуклеотидын дарааллын бүсийг хэлнэ. Энэ хооронд ORF-ийг тасалдуулах кодон зогсохгүй. Эхлэх ба зогсоох кодон хоорондын нуклеотидын дараалал нь амин хүчлийг кодлодог. Ерөнхийдөө эхлэл кодон нь ATG, зогсоох кодон нь TAG, TAA, TGA байдаг. ORF нь хөрвүүлж, орчуулах үед функциональ уураг өгдөг. Тиймээс ORF нь эхлэл кодон, дунд хэсгийн хэд хэдэн кодон, зогсолт кодоныг агуулдаг. Сонирхолтой нь, ORF нь гурваар хуваагдаж болох урттай.
Зураг 02: Унших хүрээг нээх
Прокариотуудад интрон байдаггүй тул ORF нь мРНХ-д шууд транскрипц хийдэг генийн кодлох дараалал юм. Тиймээс CDS ба PRF нь прокариотуудад ижил байдаг. Прокариотуудын генийг хайхдаа ORF-ийг илрүүлэх, прокариотуудад генийг олоход хялбар байдаг. Эукариотуудад интрон байдаг тул ORF нь боловсруулалт эсвэл РНХ залгасны дараа үүсдэг кодон дараалал юм. ORF нь урт хугацааны ORF нь генийн нэг хэсэг байх магадлалтай тул генийг урьдчилан таамаглахад тусалдаг нотолгоо юм.
CDS болон ORF хоёрын ижил төстэй зүйл юу вэ?
- Прокариотуудад CDS болон ORF нь адилхан.
- Хоёулаа эхлэл ба зогсоох кодонтой.
- Тэдэнд гурваар хуваагдаж болох олон тооны нуклеотид байдаг.
- Тэд орчуулагдсаны дараа амин хүчлийн дараалал үүсгэдэг.
CDS болон ORF хоёрын ялгаа юу вэ?
CDS нь уураг болж хувирдаг генийн жинхэнэ хэсэг бөгөөд ORF нь эхлэл кодон ба зогсолтын кодон хоорондын ДНХ-ийн суналт юм. Энэ бол CDS ба ORF хоёрын гол ялгаа юм. Цаашилбал, CDS нь интрон агуулаагүй боловч ORF нь интрон агуулсан байж болно. CDS нь мРНХ-ийн бүрэн дараалалд бүрэн хуулбарлагддаг бол ORF нь мРНХ-ийн дарааллын нэг хэсэг байж болно. Тиймээс энэ нь CDS болон ORF хоёрын өөр нэг ялгаа юм.
Доор инфографик хүснэгтийг CDS болон ORF-ийн ялгааг зэрэгцүүлэн харуулав.
Хураангуй – CDS ба ORF
CDS болон ORF нь генийн хоёр чухал хэсэг юм. CDS нь уураг болж хувирдаг ДНХ-ийн бодит хэсгийг хэлдэг. ORF нь "ATG" эхлэл кодоноор эхэлж, төгсгөлийн гурван кодоны аль нэгээр (TAA, TAG эсвэл TGA) төгсдөг ДНХ-ийн дараалал юм. ORF нь генийн бүрэн мРНХ-ийн нэг хэсэг байж болно. Гэсэн хэдий ч генийн кодчиллын дараалал нь мРНХ-ийн дарааллыг бүрэн хуулж авдаг. Бүх CDS нь ORF юм. Гэхдээ бүх ORF нь CDS биш юм. Энэ нь CDS болон ORF хоёрын ялгааг нэгтгэн харуулав.
