CGH ба массивын CGH хоёрын гол ялгаа нь CGH нь бага нарийвчлалтай туршилтын дээжийн ДНХ-ийн хуулбарын тооны өөрчлөлтийг шинжлэх уламжлалт молекул цитогенетик арга бөгөөд массив CGH нь бүрэн автоматжуулсан молекул цитогенетик арга юм. өндөр нарийвчлалтай туршилтын дээжийн ДНХ дахь хуулбарын тооны өөрчлөлтийг шинжлэх.
CGH болон массив CGH нь хувь хүний хуулбарын тооны өөрчлөлтийг илрүүлэх хоёр арга юм. Хуулбарын тооны хэлбэлзэл нь геномын давтагдах хэсгүүдийг хэлнэ. Хувь хүний хуулбарын тоо өөр өөр байдаг. Хуулбарлах дугаарын өөрчлөлтийг ерөнхийдөө богино давталт ба урт давталт гэж хоёр бүлэгт ангилдаг. Богино тооны хуулбарын өөрчлөлтийн хамгийн алдартай жишээнүүдийн нэг бол антинтин ген дэх CAG тринуклеотидын давтагдах явдал юм. Энэ нь хантингтин гэж нэрлэгддэг мэдрэлийн эмгэгийг үүсгэдэг. Удаан давтагдсан хуулбарын тооны өөрчлөлтийн хамгийн сайн жишээ бол инсулины эсэргүүцлийг үүсгэдэг альфа амилаза ген юм. Хуулбарын дугаарын өөрчлөлтийг FISH, CGH, CGH массив зэрэг техникээр илрүүлж болно.
CGH гэж юу вэ?
CGH нь шинжилгээний дээжийн ДНХ-ийн хуулбарын тооны өөрчлөлтийг жишиг дээжтэй харьцуулан шинжлэх уламжлалт молекул цитогенетик арга юм. Энэ нь автоматжуулсан техниктэй харьцуулахад бага нарийвчлалтай. Энэ аргын зорилго нь өөр өөр эх сурвалжаас авсан хоёр геномын ДНХ-ийн дээжийг хурдан бөгөөд үр дүнтэй харьцуулах явдал юм.
Зураг 01: CGH
Уг процедур нь ДНХ-ийг туршилт, лавлагаа гэсэн хоёр эх сурвалжаас тусгаарлах явдал юм. Дараа нь дараагийн алхам бол туршилтын болон лавлагааны ДНХ-ийн дээжийг өөр өөр өнгийн флюорофороор бие даасан шошголох явдал юм. Дараа нь нэг судалтай ДНХ-ийн дээж авахын тулд хоёр ДНХ-ийн дээжийг денатурат болгосон. Эцэст нь хромосомын метафазын хэвийн тархалттай 1:1 харьцаатай хоёр үр дүнд хүрсэн ДНХ-ийн дээжийг эрлийзжүүлэх ажлыг гүйцэтгэсэн. Хромосомын ялгааг флюресцент микроскоп болон компьютерийн программ ашиглан хоёр эх сурвалжийн хооронд тодорхойлж болно. Цаашилбал, CGH техник нь зөвхөн тэнцвэргүй хромосомын эмгэгийг илрүүлэх чадвартай.
Масиви CGH гэж юу вэ?
Масив CGH нь шинжилгээний дээжийн ДНХ-ийн хуулбарын тооны өөрчлөлтийг лавлагаа дээжтэй харьцуулах бүрэн автоматжуулсан молекул цитогенетик арга юм. Энэ нь илүү өндөр нягтралтай бөгөөд уламжлалт CGH-ийн хязгаарлалтыг багасгах зорилгоор боловсруулсан. CGH массив нь CGH-ийн зарчмуудыг бичил массив ашиглахтай хослуулсан. Метафазын хромосомын тархалтыг ашиглахын оронд энэ арга нь ДНХ-ийн жижиг сегментүүд бүхий слайдуудыг зорилтот болгон ашигладаг. Эдгээр бичил массивуудыг хатуу шилэн тулгуур дээр бага хэмжээний ДНХ (зонд) хийж, хөдөлгөөнгүй болгох замаар хийсэн. Сорьцын хэмжээ нь олигонуклеотидаас бактерийн хиймэл хромосом хүртэл янз бүр байж болно.
Зураг 02: CGH массив
Сондоноос үл хамааран CGH массивын үндсэн арга нь CGH-тэй төстэй. Микромассив агуулсан датчикуудыг бэлтгэсний дараа өөр өөр өнгийн флюорофороор шошгологдсон хоёр ДНХ-ийн дээжийг (туршилт ба лавлагаа) хольж, микро массив руу нэмнэ. Дээж дэх ДНХ нь денатурацийн улмаас нэг судалтай байдаг тул энэхүү ДНХ нь цувсан нэг судалтай зондуудтай эрлийзждэг. Дижитал дүрслэлийн системийг ашиглан хоёр эх сурвалжийн хромосомын ялгааг тодорхойлох боломжтой.
CGH болон CGH массивуудын хооронд ямар төстэй зүйл байдаг вэ?
- CGH болон массив CGH нь хуулбарын дугаарын өөрчлөлтийг илрүүлэх хоёр арга юм.
- Эдгээр нь молекул цитогенетик аргууд юм.
- Хоёр арга нь тэнцвэргүй хромосомын эмгэгийг оношилдог.
- Флуорофор нь хоёр аргад оролцдог.
- Хуулбарын тооны өөрчлөлтөөс шалтгаалсан удамшлын эмгэгийг илрүүлэхэд энэ хоёр аргыг ашиглаж болно.
- Тэдгээрийг харьцуулсан геномын шинжилгээнд өргөн ашигладаг.
CGH болон Array CGH хоёрын ялгаа юу вэ?
CGH нь нарийвчлал багатай туршилтын дээжийн ДНХ-ийн хуулбарын тооны өөрчлөлтийг шинжлэх уламжлалт молекул цитогенетик арга бол массив CGH нь шинжилгээний дээжийн ДНХ-ийн хуулбарын тооны өөрчлөлтийг шинжлэх бүрэн автомат молекул цитогенетик арга юм. Энэ нь илүү өндөр нарийвчлалтай. Тиймээс энэ нь CGH ба массив CGH хоёрын гол ялгаа юм. Цаашилбал, CGH-д туршилтын болон лавлагаа ДНХ-ийн дээж нь хромосомын хэвийн метафазын тархалттай эрлийзждэг бол массивын CGH-д туршилтын болон лавлагаа ДНХ-ийн дээжүүд нь бичил массив агуулсан хөдөлгөөнгүй ДНХ-ийн датчикуудтай эрлийзждэг.
Доорх инфографик нь CGH болон CGH массивын ялгааг зэрэгцүүлэн харьцуулахын тулд хүснэгт хэлбэрээр жагсаасан болно.
Хураангуй – CGH ба массив CGH
CGH ба массив CGH нь тэнцвэргүй хромосомын эмгэгийг илрүүлэх хоёр молекул цитогенетик арга юм. Тэдгээрийг харьцуулсан геномын шинжилгээнд өргөн ашигладаг. CGH нь бага нарийвчлалтай туршилтын дээжийн ДНХ-ийн хуулбарын тооны өөрчлөлтийг шинжлэх уламжлалт молекул цитогенетик арга юм. Үүний эсрэгээр CGH массив нь өндөр нарийвчлалтай туршилтын дээжийн ДНХ-ийн хуулбарын тооны өөрчлөлтийг шинжлэх бүрэн автомат молекул цитогенетик арга юм. Тиймээс энэ нь CGH болон CGH массив хоорондын ялгааг нэгтгэн харуулав.
