Үндсэн ялгаа – VNTR ба STR
ДНХ-ийн судалгаа нь филогенетик харилцааг ойлгох, тодорхойлох, удамшлын өвчнийг оношлох, организмын геномыг зураглахад асар их ашиг тустай. ДНХ-ийн шинжилгээтэй холбоотой хэд хэдэн арга техникийг тодорхой ген эсвэл тодорхойгүй ДНХ-ийн сан дахь ДНХ-ийн дарааллыг тодорхойлоход ашигладаг. Тэдгээрийг генетикийн маркер гэж нэрлэдэг. Генетик маркеруудыг молекул биологид хувь хүн болон зүйлийн хоорондын генетикийн өөрчлөлтийг тодорхойлоход ашигладаг. Хувьсах тооны тандем давталт (VNTR) ба богино тандем давталт (STR) нь хувь хүмүүсийн дунд полиморфизмыг харуулдаг генетикийн хоёр төрлийн маркер юм. Хоёр төрөл хоёулаа кодлогдоогүй давтагдах ДНХ бөгөөд энэ нь тандем давталт юм. Тэдгээр нь хромосомын дотор толгойноос сүүл хүртэл байрладаг. VNTR нь богино нуклеотидын дараалал хэд хэдэн удаа давтагддаг геномын хэсэг юм. STR нь геномын ДНХ-ийн өөр нэг хэсэг бөгөөд хоёроос арван гурван нуклеотидаас бүрдэх зуу дахин давтагдах нэгж хэлбэрээр зохион байгуулагддаг. VNTR ба STR хоёрын гол ялгаа нь давтагдах дараалал дахь нуклеотидын тоо юм. VNTR-ийн давтагдах нэгж нь 10-100 нуклеотид, харин STR-ийн давтагдах нэгж нь 2-13 нуклеотидээс бүрддэг. VNTR болон STR нь шүүх эмнэлгийн судалгаанд өргөн хэрэглэгддэг.
VNTR гэж юу вэ?
Тандем давталт нь тодорхой хромосомын байршилд толгойноос сүүл хүртэл давтагдах ДНХ-ийн богино дараалал юм. Тандем давталт дотор өөр дараалал эсвэл нуклеотид байхгүй. Геномд хэд хэдэн төрлийн тандем давталт байдаг. VNTR нь 10-аас 100 нуклеотидаас бүрдэх давтагдах нэгж бүхий тандем давталтын нэг төрөл юм. VNTR бол жижиг хиймэл дагуулын төрөл юм. Эдгээр тандем давталтыг олон хромосомоос олж болно. Эдгээр нь хүний геномын дотор оршдог ба хромосомын субтеломерийн бүсэд голчлон байршдаг.
VNTR нь хувь хүмүүсийн дунд давтагдах полиморфизмыг харуулдаг. Хромосомын тодорхой байршил дахь VNTR-ийн урт нь тухайн ДНХ-ийн хэсэгт зохион байгуулагдсан давтагдах нэгжүүдийн тоо өөр өөр байдаг тул хувь хүмүүсийн дунд маш их өөрчлөгддөг. Тиймээс VNTR-ийг хувь хүнийг тодорхойлох хүчирхэг хэрэгсэл болгон ашиглаж болох ба VNTR шинжилгээг генетик, биологийн судалгаа, шүүх эмнэлэг, ДНХ-ийн хурууны хэвлэлт зэрэг олон салбарт ашигладаг. VNTRs нь ясны чөмөг шилжүүлэн суулгахад ашигласан анхны генетикийн маркерууд байв. VNTR нь шүүх эмнэлгийн ДНХ-ийн профайлд ашигласан анхны полиморф маркерууд байсан.
Зураг 01: Зургаан хүний VNTR-ийн өөрчлөлт
VNTR шинжилгээг хязгаарлах фрагментийн уртын полиморфизм, дараа нь өмнөд эрлийзжүүлэх замаар гүйцэтгэдэг. Тиймээс харьцангуй том ДНХ-ийн дээж авах шаардлагатай. VNTR профайлын тайлбар нь бас асуудалтай байдаг. Эдгээр хязгаарлалтын улмаас шүүх генетикийн шинжилгээнд VNTR-ийн хэрэглээ хязгаарлагдмал байсан бөгөөд үүнийг STR шинжилгээгээр сольсон.
STR гэж юу вэ?
STR нь тандем байдлаар зохион байгуулагдсан хоёроос арван гурван нуклеотидын давтагдах нэгжээс бүрдэх маш их давтагдах ДНХ-ийн хэсэг юм. STR нь VNTR-тэй төстэй. Гэхдээ энэ нь VNTR-ээс давтагдах дараалал дахь нуклеотидын тоо болон давталтын тооноос өөр өөр байдаг. STR нь бичил хиймэл дагуулын төрөл юм.
STR шинжилгээ нь давтагдах нэгжийн нарийн тоог хэмжихэд оролцдог. STR нь VNT-тэй адил хувь хүмүүсийн дунд маш их хувьсах шинж чанартай байдаг. STR профайл нь хүн бүрт өөр өөр байдаг. Иймээс STR шинжилгээг молекул биологид хоёр ба түүнээс дээш дээжийн ДНХ дээрх тодорхой байршлыг харьцуулах зорилгоор ашигладаг. Тиймээс STR нь молекул биологийн хүчирхэг генетикийн маркер гэж тооцогддог. Энэ нь тэдний өндөр полиморфизм, харьцангуй богино урттай тул хувь хүнийг тодорхойлох маш сайн хэрэглүүрээр хангадаг.
Өнөөдрийн байдлаар STR нь шүүх генетикийн шинжлэх ухаанд генетикийн полиморфизмын шинжилгээнд хамгийн түгээмэл хэрэглэгддэг хэрэгсэл юм. Ихэнх шүүх эмнэлгийн хэргийн ажилд STR полиморфик шинжилгээ ордог. STR loci нь геном даяар тархсан байдаг. Хромосомд олон мянган STR байдаг бөгөөд эдгээрийг шүүх эмнэлгийн шинжилгээнд ашиглаж болно. STR шинжилгээ нь VNTR шинжилгээ шиг хязгаарлалтын уртын полиморфизмыг агуулдаггүй. STR шинжилгээ нь хязгаарлалтын ферменттэй ДНХ-г огтолж авдаггүй. Тусгай зондуудыг ДНХ-д хүссэн бүс нутгийг холбоход ашигладаг бөгөөд ПГУ-ын аргыг ашиглан STR-ийн уртыг тодорхойлно.
Зураг 02: Дээж хоорондын STR өөрчлөлт
VNTR болон STR хоёрын ижил төстэй зүйл юу вэ?
- VNTR болон STR нь кодчилдоггүй ДНХ юм.
- Хоёулаа тандем давталт.
- ДНХ-ийн хэсгийн уртын зөрүүгээс шалтгаалан аль аль нь хувь хүмүүсийн полиморфизмыг харуулдаг.
- Хоёуланг нь ДНХ-ийн хурууны хээ болон шүүх эмнэлгийн судалгаанд хүчирхэг генетик маркер болгон ашигладаг.
VNTR болон STR хоёрын ялгаа юу вэ?
VNTR vs STR |
|
| VNTR нь кодлогддоггүй, давтагдах ДНХ бөгөөд богино нуклеотидын дарааллаар давтагддаг. | STR нь хосолсон байдлаар зохион байгуулагдсан хоёроос арван гурван нуклеотидын давтагдах нэгжээс бүрдэх маш их давтагдах ДНХ-ийн хэсэг юм. |
| Хэмжээ | |
| VNTR нь STR-ээс том байна. | STR нь VNTR-ээс бага. |
| Давтах дараалал дахь нуклеотидын тоо | |
| VNTR-ийн давтагдах нэгж нь 10-100 нуклеотидээс бүрдэнэ. | STR-ийн давтагдах нэгж нь 2-13 нуклеотидээс бүрдэнэ. |
Хураангуй – VNTR vs STR
VNTR болон STR нь молекул биологи, ялангуяа шүүх генетикийн салбарт ашиглагддаг хоёр хүчирхэг генетик маркер юм. VNTR нь жижиг хиймэл дагуулын төрөл бөгөөд STR нь микро хиймэл дагуул юм. VNTR болон STR нь кодчилдоггүй, маш их давтагддаг ДНХ юм. Эдгээр нь тандемийн давталт юм. VNTR болон STR-ийн ерөнхий бүтэц ижил байна. Гэсэн хэдий ч давтагдах дараалал дахь нуклеотидын тоо, урт нь өөр өөр байдаг. VNTR нь 10-100 нуклеотидаас бүрдэх давтагдах дараалалтай. STR нь 2-13 нуклеотидаас бүрдэх давтагдах дараалалтай. Энэ бол VNTR болон STR хоёрын ялгаа юм.
VNTR vs STR-н PDF хувилбарыг татаж авах
Та энэ нийтлэлийн PDF хувилбарыг татаж аваад офлайн зорилгоор ашиглах боломжтой. PDF хувилбарыг эндээс татаж авна уу VNTR болон STR хоорондын ялгаа.
