NGS болон WGS-ийн гол ялгаа нь дараагийн үеийн дараалал (NGS) нь өндөр дамжуулалт, бага өртөгтэй, хурдтай зэрэгцээ 2-р үеийн дараалал тогтоох технологи бөгөөд харин бүхэл геномын дараалал (WGS) юм. Сангерын дараалал, бууны бууны арга эсвэл өндөр дамжуулалтын NGS дараалал зэрэг дарааллын техникийг ашиглан нэг дор эсийн бүх геномын ДНХ-г шинжлэх цогц арга.
Сүүлийн хэдэн арван жилд хүн болон бусад амьтдын геномын талаарх ойлголт хурдацтай дараалал тогтоох арга техник, биоинформатик хэрэгслийг нээсэнтэй холбоотойгоор асар их нэмэгдсэн. Сангерийн дараалал зэрэг уламжлалт дарааллын техникүүд нь өөрийн гэсэн хязгаарлалттай байсан бөгөөд энэ нь дараагийн үеийн дараалал (NGS) болон нанопорын дараалал зэрэг шинэ хурдан дарааллын аргуудыг хөгжүүлэхийг шаарддаг. Бүтэн геномын дараалал тогтоох (WGS) техник нь Их Британийн Genomic England компанийн 100,000 геномын төсөл гэх мэт олон геномын судалгааны төслүүдэд аль хэдийн ашиглагдаж байгаа сүүлийн үеийн арга юм. Тиймээс NGS болон WGS нь одоогоор олон геномын төслүүдэд ашиглагдаж байгаа дарааллын хоёр арга юм.
NGS гэж юу вэ?
NGS (дараагийн үеийн дараалал) нь өндөр дамжуулалт, бага өртөгтэй, хурдтай зэрэгцээ хоёр дахь үеийн дарааллын технологи юм. Дараагийн үеийн дарааллын талаар нарийн тодорхойлолт байдаггүй. Гэхдээ бид үүнийг ердийн хялгасан судас дээр суурилсан дараалал тогтоох аргуудаас тодорхой ялгаж чадна. Дараагийн үеийн дараалал нь нэг туршилтаар нийт 1 сая суурь хосоос их хэмжээтэй ДНХ молекулын дарааллыг тогтоох боломжийг олгодог. Энэ нь олон хүний ДНХ-ийн дарааллыг нэгэн зэрэг хийх боломжийг олгох гэх мэт урьд өмнө хэзээ ч байгаагүй хурд, өндөр дамжуулах чадварыг санал болгодог. Энэ нь бие даасан дарааллын урвалын хэмжээг багасгах замаар хийгддэг. Үүнээс гадна, энэ нь багаж хэрэгслийн хэмжээг хязгаарлаж, нэг урвал дахь урвалжийн зардлыг бууруулдаг.
Зураг 01: NGS платформууд
NGS нь биологийн судалгааны салбарт аль хэдийн хувьсгал хийсэн богино хугацааны дараалал тогтоох арга юм. Цаашилбал, NGS-ийг де ново геномын дараалал, бүхэл геномын дараалал, транскриптомын шинжилгээ, жижиг РНХ ба микро РНХ дараалал, зорилтот дахин дараалал, бүхэл экзомын дараалал зэрэг төрөл бүрийн салбарт ашигладаг.
WGS гэж юу вэ?
WGS (бүх геномын дараалал) нь Сангерийн дараалал, бууны бууны арга эсвэл өндөр дамжуулалттай NGS дараалал зэрэг дарааллын техникийг ашиглан нэг удаад эсийн бүх геномын ДНХ-д дүн шинжилгээ хийх цогц арга юм. Үүнийг мөн геномын бүрэн дараалал эсвэл бүрэн геномын дараалал гэж нэрлэдэг. Бүтэн геномын дараалал нь организмын бүх хромосомын ДНХ, түүнчлэн митохондри дахь ДНХ, ургамлын хувьд хлоропласт дахь ДНХ-ийг нэг дор эрэмбэлдэг. WGS нь эрдэмтэд ДНХ-ийн иж бүрдлийг бүрдүүлдэг бүх үсгүүдийн яг дарааллыг унших боломжийг олгодог. NGS платформыг ашигладаг WGS нь эмнэлзүйн тохиргоонд хувьсгал хийх төлөвтэй байна.
Зураг 02: WGS ба шаталсан бууны дараалал
Бүтэн геномын дарааллыг 2014 онд эмнэлзүйн тусламж үйлчилгээнд нэвтрүүлсэн. Цаашилбал, WGS-ийн хэрэглээ нь SNP түвшинд генийн дараалал тогтоох, холбоо тогтоох судалгаа, хувь хүний анагаах ухаанд эмчилгээний интервенц, хувьслын биологи, харьцуулсан геномын шинжилгээ зэрэгт функциональ хувилбаруудыг тодорхойлоход ордог., мутаци болон өөрчлөн зохион байгуулалтын судалгаа, ховор хувилбаруудын холбоог судлах, өвчинд мэдрэмтгий байдал болон эмийн хариу урвалыг урьдчилан таамаглах.
NGS болон WGS-ийн хооронд ямар төстэй зүйл байдаг вэ?
- NGS болон WGS нь дарааллын хоёр техник юм.
- Хоёр техник нь ДНХ эсвэл РНХ-г дараалуулдаг.
- Эдгээр техник нь шинэ бөгөөд найдвартай.
- Тэдгээрийг хоёуланг нь өвчнийг оношлох, эм илрүүлэхэд ашигладаг.
NGS болон WGS хоёрын ялгаа юу вэ?
NGS нь өндөр хүчин чадалтай, хямд өртөгтэй, хурдтай, асар их зэрэгцээ хоёр дахь үеийн дарааллын технологи бөгөөд WGS нь эсийн геномын ДНХ-г бүхэлд нь нэг дор шинжлэх цогц арга юм. Сангерийн дараалал, бууны бууны ойртолт эсвэл өндөр дамжуулалттай NGS дараалал зэрэг. Тэгэхээр энэ бол NGS ба WGS хоёрын гол ялгаа юм. Цаашилбал, NGS нь зөвхөн хоёр дахь үеийн дарааллын аргуудаас бүрддэг бол WGS нь эхний, хоёр, гурав дахь үеийн дарааллын аргуудаас бүрдэнэ.
Дараах хүснэгтэд NGS болон WGS-ийн ялгааг хүснэгт хэлбэрээр үзүүлэв.
Хураангуй – NGS vs WGS
Сүүлийн хэдэн арван жилд орчин үеийн молекулын судалгаанд янз бүрийн дарааллын техникийг тогтмол хэрэглэж ирсэн. Тэр ч байтугай тэдгээр нь олон эмнэлзүйн хэрэглээнд зориулагдсан маш хүчирхэг хэрэгсэл юм. NGS ба WGS нь одоо олон геномын төслүүдэд нэгдэж байгаа дарааллын хоёр арга юм. NGS нь өндөр нэвтрүүлэх чадвар, хямд өртөг, хурдтай хоёр дахь үеийн дарааллын технологи юм. Нөгөөтэйгүүр, WGS нь Сангерийн дараалал, буун бууны арга эсвэл өндөр дамжуулалттай NGS дараалал зэрэг дарааллын техникийг ашиглан нэг дор бүхэл геномын ДНХ эсвэл эсийн бүрэн геномын ДНХ-ийг шинжлэх арга юм. Энэ бол NGS болон WGS-ийн ялгааны хураангуй юм.
