Т4 ДНХ лигаз ба E. coli ДНХ лигазын гол ялгаа нь T4 ДНХ лигаз нь T4 бактериофагаас тусгаарлагдсан фермент бөгөөд E. coli ДНХ лигаз нь E. coli нянгаас тусгаарлагдсан фермент юм..
ДНХ-ийн лигаза нь фосфодиэстерийн холбоо үүсгэн ДНХ-ийн хэлхээг хооронд нь холбоход тусалдаг тусгай төрлийн фермент юм. Энэ нь амьд организмын ДНХ-ийн нэг судал, хоёр хэлхээний тасалдлыг засах чухал үүрэг гүйцэтгэдэг. Түүгээр ч зогсохгүй ДНХ-ийн лигаза нь ДНХ-ийн засвар болон ДНХ-ийн хуулбарлахад ашиглагддаг. Дээрх хэрэглээнээс гадна ДНХ лигаз нь рекомбинант ДНХ технологи зэрэг молекул биологийн туршилтуудад өргөн хэрэглэгддэг. T4 ДНХ лигаз ба E. coli ДНХ лигаз нь хоёр төрлийн ДНХ лигазын фермент юм.
Т4 ДНХ Лигаза гэж юу вэ?
T4 ligase нь бактериофаг T4-ээс тусгаарлагдсан ДНХ-ийг холбодог фермент юм. T4 бактериофаг нь гэдэсний савханцарыг халдварладаг вирус юм. T4 ligase фермент нь молекул биологийн лабораторийн судалгаанд хамгийн өргөн хэрэглэгддэг ДНХ лигаз юм. Ер нь T4 ligase нь зэргэлдээх нуклеотидын 5' фосфат ба 3' гидроксил бүлгүүдийн хооронд хоёр хэлхээтэй ДНХ-ийн нэгдмэл эсвэл мохоо төгсгөлтэй хоёр хэлхээний нэгдлийг хурдасгадаг. Энэ нь РНХ-ийг хоёр талт молекул дахь ДНХ эсвэл РНХ-ийн хэлхээнд холбоход түлхэц өгч чаддаг. Гэсэн хэдий ч энэ фермент нь нэг судалтай нуклейн хүчлүүдтэй нэгдэхгүй. Түүнчлэн, энэ нь мохоо төгсгөлтэй ДНХ-ийг E. coli ДНХ лигазаас хамаагүй илүү үр дүнтэй холбож чаддаг.
Зураг 01: Т4 ДНХ лигаз
Энэ фермент нь кофакторын хувьд ATP-ийг шаарддаг. Зарим генетикийн инженерийн судалгааны туршилтууд нь зэрлэг төрлийн Т4 ДНХ лигазаас илүү идэвхтэй ДНХ-ийн лигазын ферментийг аль хэдийн гаргаж авсан. Аргын аль нэгэнд тэд T4 ДНХ лигазыг p50 эсвэл NF-kB молекул болгон самнах замаар нэгдэх ферментийн молекулыг бий болгосон. Энэхүү шинэ T4 ligase фермент нь зэрлэг төрлийн Т4 ДНХ-ийн лигазаас клончлох зорилгоор мохоо төгсгөлийн ligations-д 160% илүү идэвхтэй байсан. Цаашилбал, Т4 ДНХ лигазын холбох урвалыг илүү нарийвчлалтай хурдасгах оновчтой температур нь 16 °C байна.
E Coli ДНХ Лигаза гэж юу вэ?
Э. coli ДНХ лигаза нь E. coli бактериас тусгаарлагдсан фермент юм. E. coli ДНХ-ийн лигаз үүсгэх үүрэгтэй ген нь lig ген юм. E. coli ДНХ, лигаза болон ихэнх прокариотуудын ДНХ лигазууд нь фосфодиэфирийн холбоог үүсгэхийн тулд NAD (никотинамид аденины динуклеотид)-ээр олж авсан энергийг ашигладаг.
Зураг 02: E. Coli ДНХ лигаз
Э. coli ДНХ-ийн лигаза нь 5' фосфатын төгсгөл ба 3' гидроксил төгсгөл агуулсан давхар судалтай ДНХ-ийн фрагментуудын хооронд фосфодиэфирийн холбоо үүсэхийг катализлах замаар ДНХ-ийн фрагментуудыг холбож чаддаг холбогч фермент юм. Түүнчлэн полиэтилен гликолоор молекулын бөөгнөрөл гэх мэт онцгой нөхцлөөс бусад тохиолдолд мохоо төгсгөлтэй ДНХ-ийг холбодоггүй. Мөн РНХ-ийг ДНХ-д үр дүнтэй холбож чадахгүй. Цаашилбал, E. coli ДНХ лигазын идэвхийг ДНХ полимераз 1-ийг зөв концентрацитай байлгах замаар сайжруулж болно. Харин ДНХ-полимераз 1 ферментийн концентраци өндөр байвал E. coli-ийн ДНХ лигазын идэвхжилд сөрөг нөлөө үзүүлдэг.
Т4 ДНХ Лигаз ба Е Коли ДНХ Лигаз хоёрын ижил төстэй зүйл юу вэ?
- T4 ДНХ лигаза ба E-coli ДНХ лигаза нь хоёр төрлийн ДНХ лигаз фермент юм.
- Хоёулаа уураг нь амин хүчлээс тогтдог.
- Эдгээр ферментүүд нь давхар ДНХ-д 5' фосфат ба 3' гидроксил төгсгөлийн хооронд фосфодиэфирийн холбоо үүсэхийг катализатор болгодог.
- Тэдгээрийг рекомбинант ДНХ технологи зэрэг молекул биологийн туршилтуудад өргөнөөр ашигладаг.
Т4 ДНХ Лигаз ба Е Коли ДНХ Лигаз хоёрын ялгаа юу вэ?
T4 ДНХ-ийн лигаза нь бактериофаг T4-ээс ялгардаг фермент бол E. coli ДНХ-ийн лигаз нь E. coli бактериас тусгаарлагдсан фермент юм. Тиймээс энэ нь T4 ДНХ лигаз ба E. coli ДНХ лигазын гол ялгаа юм. Цаашилбал, T4 ДНХ лигазын эрчим хүчний эх үүсвэр нь ATP юм. Нөгөө талаар E. coli ДНХ лигазын энергийн эх үүсвэр нь NAD юм.
Доорх инфографик нь T4 ДНХ лигаз ба Е коли ДНХ-ийн лигазын ялгааг зэрэгцүүлэн харьцуулах зорилгоор хүснэгт хэлбэрээр үзүүлэв.
Хураангуй – T4 ДНХ лигаз ба Е коли ДНХ лиг
T4 ДНХ лигаз ба E. coli ДНХ лигаза нь давхар ДНХ-д 5' фосфат ба 3' гидроксил төгсгөлийн хооронд фосфодиэфирийн холбоо үүсэхийг идэвхжүүлдэг хоёр фермент юм. T4 ligase нь T4 бактериофагаас тусгаарлагдсан фермент бөгөөд E. coli ДНХ лигаза нь E. coli бактериас тусгаарлагдсан фермент юм. Энэ бол T4 ДНХ лигаз ба Е коли ДНХ лигазын гол ялгаа юм.
