MLVA болон MLST-ийн гол ялгаа нь MLVA нь бичил биетний төрөл зүйлийг тодорхойлохдоо ДНХ-ийн хосолсон дарааллын полиморфизмыг ашигладаг бол MLST нь бичил биетний төрөл зүйлийг тодорхойлохын тулд олон гэрийн үйлчлэгч генүүдийн дотоод хэлтэрхий ДНХ-ийн дарааллын полиморфизмыг ашигладагт оршино.
Халдварын эх үүсвэр, замыг тодорхойлоход ихэвчлэн бичил биетний бичилтийг ашигладаг. Энэ нь дэгдэлтийг баталгаажуулж эсвэл үгүйсгэдэг. Микробын төрөл нь эрүүл мэндийн тусламж үйлчилгээтэй холбоотой эмгэг төрүүлэгч бичил биетний дамжилтыг илрүүлж, хоруу чанар бүхий омгийг таньдаг. Түүнчлэн бичил биетний төрөл нь эмгэг төрүүлэгч бичил биетний төрөл зүйлийн хяналтын арга хэмжээний үр нөлөөг үнэлдэг. MLVA болон MLST нь бичил биетний төрөлжүүлэхэд ашигладаг молекул биологийн хоёр арга юм.
MLVA гэж юу вэ?
Олон локус VNTR шинжилгээ (MLVA) нь бичил биетний төрлийг тодорхойлохдоо ДНХ-ийн дарааллаар давтагдах полиморфизмыг ашигладаг молекул биологийн арга юм. Энэ нь тодорхой бичил биетний генетикийн шинжилгээнд ашигладаг арга юм.
MLVA-ийн эхний үе шатанд зорилтот VNTR локус бүрийг ПГУ-ын дагуу бүс нутгийн тусгай праймеруудаар олшруулдаг. Дараа нь олж авсан хэсгүүдийг капилляр дараалалд электрофорезоор тусгаарлана. Локус тус бүрийн генотип, дээж бүрээс эмхэтгэсэн үр дүн нь төрөл зүйл нь мэдэгдэж буй бичил биетнийг тодорхойлох боломжийг олгодог. Энэ нь мөн аллель бичих, MLVA мэдээллийн сантай харьцуулах замаар дэд зүйлүүдийг тодорхойлох боломжийг олгодог.
Зураг 01: MLVA
Энэ MLVA арга нь MLST аргаас илүү сонголттой. Цаашилбал, MLVA арга нь ДНХ-ийн дараалал тогтоох алхам шаарддаггүй. Тиймээс энэ нь ойрын дэд зүйл эсвэл клон төрөл зүйлүүдийг ялгах боломжтой болгодог.
MLST гэж юу вэ?
Multilocus sequence typing (MLST) нь бичил биетний төрлийг тодорхойлоход олон гэрийн үйлчлэгч генийн дотоод хэлтэрхийнүүдийн ДНХ дарааллын полиморфизмыг ашигладаг техник юм. MLST нь генетикийн шинжилгээний олон байршлыг тодорхойлох арга юм.
Зураг 02: MLST
Энэ нь бичил биетний төрөл бүрийн омгийг ялгахад жишиг техник болгон ашигладаг дарааллын бичих төрөл юм. Энэ арга нь гэр ахуйн генийн дараалалд суурилдаг. Гэр ахуйн генүүд нь ихэвчлэн нян зэрэг бичил биетний чухал уургийг кодлодог. Гэр ахуйн генийн эдгээр дараалал нь цаг хугацааны явцад тогтвортой полиморфизмыг илтгэдэг онцлогтой. Тиймээс гэр ахуйн генийн дарааллын ялгаа нь омгуудыг бие биенээсээ ялгахад хангалттай юм. Цаашилбал, анхны MLST схемийг боловсруулсан нь менингококкийн менингит ба септицемийн үүсгэгч Neisseria meningitidis юм. MLST-ийг нэвтрүүлснээс хойш зөвхөн хүний өвчин үүсгэгч төдийгүй ургамлын эмгэг төрүүлэгчид хэрэглэж ирсэн.
MLVA болон MLST хоёрын ижил төстэй зүйл юу вэ?
- MLVA болон MLST нь бичил биетний төрөлжүүлэхэд ашигладаг молекул биологийн хоёр арга юм.
- Хоёр аргыг микробын филогенетик шинжилгээнд ашиглаж болно.
- Хоёр техник нь генетикийн полиморфизм дээр суурилдаг.
- Эдгээрийг бичил биетний эмгэг төрүүлэгчид үүсгэдэг хүний өвчнийг илрүүлэхэд ашиглаж болно.
- Хоёр аргыг чадварлаг молекул биологичид гүйцэтгэх ёстой.
MLVA болон MLST хоёрын ялгаа юу вэ?
MLVA нь бичил биетний төрлийг тодорхойлохын тулд ДНХ-ийн дарааллаар давтагдах полиморфизмыг ашигладаг техник юм. Үүний зэрэгцээ, MLST нь бичил биетний төрөл зүйлийг тодорхойлохын тулд олон гэрийн генийн дотоод фрагментуудын ДНХ-ийн дарааллын полиморфизмыг ашигладаг арга юм. Тиймээс энэ нь MLVA ба MLST-ийн гол ялгаа юм. Цаашилбал, MLVA арга нь MLST аргаас илүү сонгомол.
Доорх инфографик нь MLVA болон MLST-ийн ялгааг зэрэгцүүлэн харьцуулахын тулд хүснэгт хэлбэрээр үзүүлэв.
Хураангуй – MLVA ба MLST
MLVA болон MLST нь бичил биетний төрөлжүүлэхэд ашигладаг молекул биологийн хоёр арга юм. MLVA нь бичил биетний төрөл зүйлийг тодорхойлохдоо ДНХ-ийн хосолсон дарааллын полиморфизмыг ашигладаг бол MLST нь бичил биетний төрөл зүйлийг тодорхойлохдоо олон гэрийн генийн дотоод хэлтэрхийнүүдийн ДНХ-ийн дарааллын полиморфизмыг ашигладаг. Энэ бол MLVA болон MLST хоёрын гол ялгаа юм.
