QTL болон GWAS-ын гол ялгаа нь шинжилгээнд ашигласан дарааллын төрлөөс хамаарна. QTL нь полиген өв залгамжлалтай холбоотой фенотип шинж чанарыг шинжлэхийн тулд холбоосын генийн байршлыг ашигладаг бол GWAS нь тодорхой нөхцөл байдлын нэг нуклеотидын полиморфизмыг шинжлэхийн тулд бүхэл геномын дарааллыг ашигладаг.
QTL газрын зураг болон GWAS нь янз бүрийн шинж тэмдгүүдийн генетикийн шинжилгээнд чухал үүрэг гүйцэтгэдэг. Цаашилбал, тэдгээр нь тодорхойгүй шалтгаантай янз бүрийн өвчний нөхцөл байдлыг шинжлэхэд чухал ач холбогдолтой. Үүнээс гадна, дараалал нь хоёр техникт гол үүрэг гүйцэтгэдэг. Нарийвчлал, нарийвчлалыг нэмэгдүүлэхийн тулд эдгээр техникийг бусад өндөр дамжуулах чадвартай техниктэй хослуулж болно.
QTL гэж юу вэ?
QTL нь Quantitative Trait Locus гэсэн үг. Энэ нь фенотип шинж чанартай холбоотой ДНХ-ийн хэсэг юм. Ерөнхийдөө QTL нь полиген нөлөөг үүсгэдэг. QTL-ийн тархалт харилцан адилгүй бөгөөд QTL-ийн тоо нь тухайн фенотипийн шинж чанарын өөрчлөлтийн түвшинг харуулж байна. Цаашилбал, тэдгээр нь салангид шинж чанаруудыг бус харин үндсэн тасралтгүй шинж чанарыг кодлодог.
QTL бүсүүдийг тодорхойлохдоо тодорхой QTL бүсийг дарааллаар нь эрэмбэлэх нь чухал. Түүнчлэн, судалгаа, судалгааг хялбар болгохын тулд биоинформатикийн оролцоотойгоор нийтлэг QTL бүсүүдийн дарааллын өгөгдлийг дарааллаар нь хадгалах, хадгалах явдал юм. Бид энэ техникийг QTL зураглал гэж нэрлэдэг. Дараа нь QTL бүсийн дарааллаар мэдээллийн сан үүсдэг.
Зураг 01: QTL скан
Цаашилбал, QTL дарааллын хэрэглээ нь үндсэндээ дарааллын ижил төстэй байдлыг тодорхойлох боломжтой BLAST хэрэглүүрт тулгуурладаг. Энэ нь организмын хоорондын харилцааг тодорхойлоход чухал ач холбогдолтой. Цаашилбал, тодорхой полиген фенотипийн нарийн төвөгтэй байдлыг тодорхойлоход чухал ач холбогдолтой. Энэ нь мөн тодорхой шинж чанарын хувьслыг тодорхойлдог.
Одоогоор QTL шинжилгээг ДНХ-ийн бичил массив гэх мэт өндөр дамжуулах чадвартай бусад аргуудтай хослуулж байна. Энэ нь фенотипийг илэрхийлэх шинжилгээнд чухал ач холбогдолтой. Одоогийн байдлаар эрдэмтэд QTL мэдээллийн санг хөгжүүлэх сонирхолтой байгаа тул QTL мужууд өөр өөр зүйлийн олон чухал шинж чанарыг хариуцдаг.
GWAS гэж юу вэ?
GWAS нь Genome Wide Association Study гэсэн үгийн товчлол юм. Энэ нь мөн бүхэл бүтэн геномын холбоо судалгааг хэлнэ. Эдгээр судалгаанууд нь ажиглалтын судалгаанд голчлон анхаардаг. Энэ нь ихэвчлэн тодорхой шинж чанартай холбоотой янз бүрийн хүмүүсийн генетикийн хувилбаруудад дүн шинжилгээ хийдэг. Түүнээс гадна GWAS шинжилгээнд геном бүхэлдээ чухал ач холбогдолтой.
Зураг 02: GWAS
GWAS нь янз бүрийн өвчний нөхцөлтэй холбоотой нэг нуклеотидын полиморфизмыг шинжлэх чухал хэрэгсэл юм. Энэ нь бас өргөн популяци дахь өөр өөр нэг нуклеотидын полиморфизмын харьцуулсан судалгаа юм. Үүнээс гадна GWAS-ийн судалгааны дээж маш өндөр байна; Тиймээс энэ нь мөн хөндлөн огтлолын когортын судалгааны форматыг авдаг.
Цаашилбал, зүрхний шигдээс болон зүрхний шигдээстэй холбоотой генийг шинжлэх GWAS-ийн анхны судалгаа хийгдсэн. Одоогийн байдлаар GWAS нь тодорхойгүй этиологи бүхий нарийн төвөгтэй өвчний удамшлын үндэслэлийг тодорхойлоход чухал үүрэг гүйцэтгэдэг.
QTL болон GWAS-ын хооронд ямар төстэй зүйл байдаг вэ?
- Тэд шинжилгээнд ДНХ-ийн дарааллын өгөгдөлд тулгуурладаг.
- Хоёулаа янз бүрийн дүрийн удамшлын гаралтай холбоотой.
- Цаашилбал, тэдгээрт үр дүнг гаргаж, тайлбарлахын тулд био мэдээлэл зүйн хэрэглүүр шаардлагатай.
- Тэдгээрийг олон хүн амд хийдэг.
QTL болон GWAS хоёрын ялгаа юу вэ?
QTL нь холбогдсон генийн байршлыг ашиглан полиген өв залгамжлалтай холбоотой фенотип шинж чанарыг шинжилдэг бол GWAS нь геномын бүхэл дарааллыг ашиглан тодорхой нөхцөл байдлын нэг нуклеотидын полиморфизмд дүн шинжилгээ хийдэг. Тиймээс энэ нь QTL болон GWAS хоёрын гол ялгаа юм. QTL зураглал нь геномын дарааллыг бүхэлд нь шаарддаг тул GWAS-аас харьцангуй бага төвөгтэй арга юм.
Доорх инфографик нь QTL болон GWAS-ийн ялгааг хүснэгт хэлбэрээр нэгтгэн харуулав.
Хураангуй – QTL vs GWAS
QTL зураглал болон GWAS нь янз бүрийн фенотип шинж чанаруудын генетикийн суурь байдлыг тодорхойлоход чухал үүрэг гүйцэтгэдэг. Тэд мөн янз бүрийн өвчний генетикийн үндэслэлийг шинжлэхэд тусалдаг. QTL зураглал нь тасралтгүй шинж чанарыг хариуцдаг холбоосын генүүдийн зураглалыг гаргахаас гадна полиген удамшлын генүүдийн зураглалыг багтаадаг. Нөгөө талаас GWAS нь нэг нуклеотидын полиморфизмын бүх геномын шинжилгээгээр явагддаг. Нэмж дурдахад энэ нь илүү олон хүн амд тохиолддог. Энэ бол QTL болон GWAS-ын ялгааны хураангуй юм.
